More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2653 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 517 aa  1035    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  95.55 
 
 		 517 aa  947    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  53.05 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  40.43 
 
 		 514 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  37.09 
 
 		 513 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  34.56 
 
 		 538 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  36.64 
 
 		 505 aa  203  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.33 
 
 		 516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  29.35 
 
 		 529 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  29.13 
 
 		 529 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 529 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  32.97 
 
 		 533 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 525 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  30.37 
 
 		 527 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 529 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 539 aa  183  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  30.33 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  31.44 
 
 		 522 aa  174  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  31.83 
 
 		 532 aa  173  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 535 aa  173  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  28.41 
 
 		 540 aa  173  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.98 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 520 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  28.6 
 
 		 545 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  27.36 
 
 		 536 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.11 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 		 537 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 561 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 519 aa  167  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 527 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 527 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.26 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 517 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  29.05 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  29.05 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 540 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  30.63 
 
 		 523 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 536 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.44 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 		 513 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 555 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  34.15 
 
 		 554 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 		 513 aa  160  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.02 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 527 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 536 aa  158  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.68 
 
 		 537 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 523 aa  156  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 510 aa  156  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 524 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 534 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.78 
 
 		 538 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 		 538 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 534 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  30.68 
 
 		 505 aa  149  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 		 519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 537 aa  147  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  31.08 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 534 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  30.24 
 
 		 534 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32 
 
 		 507 aa  144  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 534 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.73 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  28.75 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  30.06 
 
 		 524 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2510  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 510 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.79 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.94 
 
 		 542 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0494  extracellular solute-binding protein family 5  31.02 
 
 		 536 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.080678  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  29.95 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 512 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 507 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.31 
 
 		 524 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  26.73 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.13 
 
 		 505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 524 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 518 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.3 
 
 		 545 aa  133  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 532 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 510 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 		 538 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.35 
 
 		 532 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8313  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.74 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 595 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  31.4 
 
 		 553 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 		 508 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>