More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8313 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8313  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  100 
 
 		 516 aa  1066    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291124  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9144  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  41.22 
 
 		 507 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  38.09 
 
 		 514 aa  358  9e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 		 514 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 		 505 aa  206  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.83 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  27.41 
 
 		 514 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 		 514 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  26.67 
 
 		 520 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.45 
 
 		 512 aa  176  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.45 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  30.39 
 
 		 516 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.9 
 
 		 521 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.11 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.45 
 
 		 512 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.45 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.25 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.9 
 
 		 521 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.9 
 
 		 521 aa  174  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 521 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.9 
 
 		 521 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  26.72 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  26.72 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  26.72 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 520 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 520 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 520 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  26.92 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.25 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.81 
 
 		 524 aa  170  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.57 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  25.55 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.15 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.45 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  25.45 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  25.45 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  25.45 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  25.45 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  25.45 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  25.45 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 520 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 520 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 510 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 		 532 aa  163  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.25 
 
 		 520 aa  163  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.67 
 
 		 531 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 519 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 		 527 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 520 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.55 
 
 		 517 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 517 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 520 aa  159  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 509 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.9 
 
 		 517 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.56 
 
 		 565 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 		 508 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 495 aa  156  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 521 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 510 aa  154  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  27.65 
 
 		 529 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 		 508 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 490 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 529 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.49 
 
 		 508 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 		 535 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.19 
 
 		 535 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 509 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 528 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 		 516 aa  150  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 		 519 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  27.1 
 
 		 520 aa  149  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.45 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  24.49 
 
 		 499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 566 aa  148  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 		 533 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 527 aa  147  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>