More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1200 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  100 
 
 		 391 aa  747    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  89.74 
 
 		 391 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  55.1 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  57.4 
 
 		 392 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  56.07 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  55.04 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  53.1 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  48.45 
 
 		 393 aa  275  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  45.04 
 
 		 398 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  38.11 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  38.46 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  39.25 
 
 		 402 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  36.36 
 
 		 420 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1939  ROK family protein  37.31 
 
 		 398 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  36.05 
 
 		 399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  32.74 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  32.64 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  32.16 
 
 		 393 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  32.66 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  32.21 
 
 		 387 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  30.53 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  31.88 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  33.91 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  29.36 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  26.6 
 
 		 387 aa  113  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.59 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  30.13 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  33.33 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  26.33 
 
 		 397 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.62 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  25.44 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.03 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  23.71 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  29.7 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  33.94 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  24.93 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  24.93 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  24.93 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  24.93 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.36 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.6 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  25.14 
 
 		 363 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  33.09 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  28.23 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  30.28 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  31.59 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.57 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.24 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  31.35 
 
 		 401 aa  99.4  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  31.64 
 
 		 332 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.08 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  30.45 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  24.27 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  32.74 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  31.39 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.28 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2620  ROK family protein  33.05 
 
 		 379 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  28.29 
 
 		 418 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  29.16 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.05 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.93 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  29.51 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  31.35 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  25.89 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  28 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  28 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  33.04 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  23.55 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.92 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  26.13 
 
 		 401 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  31.36 
 
 		 398 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.19 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  31.71 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  27.15 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  30 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  29.58 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  25.84 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  32.22 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3299  ROK family protein  32.98 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233562  normal  0.194548 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  21.41 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.15 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  24.31 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  30.29 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  25.14 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  29.63 
 
 		 395 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  32.64 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  27.06 
 
 		 407 aa  89.7  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 404 aa  90.1  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.46 
 
 		 386 aa  89.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  29.63 
 
 		 406 aa  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>