More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0694 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 215 aa  425  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 229 aa  134  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0794  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.133446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 230 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 254 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  28.23 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  28.37 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 240 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  24.74 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.9 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 269 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  24.75 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0790  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 232 aa  95.1  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 241 aa  95.1  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 227 aa  94.7  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 235 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 255 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 239 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 252 aa  91.7  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  32.18 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 216 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 224 aa  91.7  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 262 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 230 aa  91.7  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 241 aa  91.3  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>