More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0582 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
664 aa  1347    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  39.04 
 
 
664 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  39.62 
 
 
656 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  36.03 
 
 
702 aa  378  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  34.96 
 
 
718 aa  379  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  35.61 
 
 
690 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  26.8 
 
 
659 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
656 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  26.62 
 
 
713 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 
653 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 
652 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 
653 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  23.03 
 
 
708 aa  124  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 
653 aa  124  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  25.96 
 
 
656 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 
687 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 
653 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 
721 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.17 
 
 
631 aa  119  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.88 
 
 
653 aa  118  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 
693 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.72 
 
 
631 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  25.07 
 
 
721 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.79 
 
 
646 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 
704 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 
653 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 
653 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 
688 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 
653 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 
807 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 
657 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 
665 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 
731 aa  108  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  22.69 
 
 
655 aa  107  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 
618 aa  107  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.98 
 
 
633 aa  106  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.62 
 
 
706 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.58 
 
 
721 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  24.34 
 
 
809 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.62 
 
 
706 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.62 
 
 
706 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.76 
 
 
706 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 
704 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 
809 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.64 
 
 
618 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 
809 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.11 
 
 
728 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 
688 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  21.91 
 
 
638 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  22.88 
 
 
717 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.27 
 
 
712 aa  101  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  23.47 
 
 
731 aa  101  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 
711 aa  99.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  24.05 
 
 
712 aa  99  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 
809 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 
709 aa  98.2  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  23.95 
 
 
665 aa  98.2  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  23.95 
 
 
665 aa  98.2  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  23.95 
 
 
665 aa  98.2  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.64 
 
 
774 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 
688 aa  97.1  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 
696 aa  96.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 
700 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 
782 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  23.6 
 
 
712 aa  96.3  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 
700 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  23.07 
 
 
774 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 
700 aa  95.5  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 
700 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 
700 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  25.2 
 
 
784 aa  95.1  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 
704 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  21.2 
 
 
703 aa  94.7  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  22.91 
 
 
774 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  22.65 
 
 
666 aa  94.7  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 
706 aa  94.7  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.92 
 
 
639 aa  94.4  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  22.91 
 
 
774 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.16 
 
 
614 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  22.91 
 
 
774 aa  94  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 
688 aa  94  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  22.91 
 
 
774 aa  94  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 
700 aa  94  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.01 
 
 
614 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  22.48 
 
 
774 aa  94  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  22.24 
 
 
665 aa  93.6  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  30.46 
 
 
666 aa  93.6  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  21.62 
 
 
730 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
700 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.2 
 
 
700 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.01 
 
 
614 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  24.38 
 
 
782 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.01 
 
 
614 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 
701 aa  92.8  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  23.54 
 
 
701 aa  92.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.2 
 
 
700 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  37.58 
 
 
686 aa  92.4  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  30.46 
 
 
666 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  23.8 
 
 
720 aa  92  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.01 
 
 
614 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>