More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7639 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  61.63 
 
 		 247 aa  307  9e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  60.82 
 
 		 247 aa  305  5.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  60.82 
 
 		 247 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9351  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.78 
 
 		 247 aa  284  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6886  ABC transporter related  59.75 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3555  ABC transporter-like protein  56.33 
 
 		 247 aa  274  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.836989  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  53.28 
 
 		 246 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  53.59 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  54.85 
 
 		 241 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  53.59 
 
 		 242 aa  264  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  53.66 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3100  ABC transporter related protein  58 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  55.56 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  54.01 
 
 		 241 aa  261  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  55.6 
 
 		 243 aa  261  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  52.7 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  53.81 
 
 		 241 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  57.02 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.11 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  54.43 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4573  ABC transporter related  55.6 
 
 		 245 aa  258  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.958024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  50.84 
 
 		 242 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  51.05 
 
 		 252 aa  258  9e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  53.66 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  55.7 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  53.41 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  51.23 
 
 		 263 aa  255  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  50.81 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  50.81 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  51.23 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  50.64 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  52.92 
 
 		 260 aa  252  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  54.66 
 
 		 249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  50.42 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  54.66 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  54.66 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  52.52 
 
 		 249 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  50 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  52.26 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  50.81 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  52.1 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  53.97 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  54.81 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 		 245 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  49.19 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  51.25 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  50.21 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  52.14 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  49.58 
 
 		 240 aa  248  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  51.24 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  51.46 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  51.05 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  48.32 
 
 		 258 aa  248  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  54.62 
 
 		 255 aa  248  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  51.04 
 
 		 253 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  52.26 
 
 		 246 aa  248  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  53.56 
 
 		 245 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  52.52 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  48.12 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  52.1 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  50.21 
 
 		 243 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  51.88 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  53.14 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  52.94 
 
 		 249 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  50 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  50.81 
 
 		 636 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.81 
 
 		 636 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.81 
 
 		 636 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  49.8 
 
 		 261 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  51.88 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  50.81 
 
 		 636 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.81 
 
 		 636 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  50.81 
 
 		 636 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  247  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  49.16 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  53.69 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  50.42 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  51.68 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  50.21 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  52.97 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  52.72 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  49.16 
 
 		 243 aa  245  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  49.58 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2777  ABC transporter related  51.24 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  51.06 
 
 		 243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.3 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  51.69 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 595 aa  244  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  50.79 
 
 		 277 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  48.74 
 
 		 240 aa  245  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  49.17 
 
 		 244 aa  245  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  50 
 
 		 242 aa  244  6e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  50.84 
 
 		 241 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  48.36 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>