More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6874 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 138 aa  264  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  39.85 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  42.75 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  47.87 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  42.37 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  37.59 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  37.01 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 219 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0188  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 172 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 172 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  50 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  41.53 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 303 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  35.77 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  34.07 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  32.81 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  40 
 
 		 292 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  40.74 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>