More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0900 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
573 aa  1146    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.476047  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.33 
 
 
573 aa  749    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.35 
 
 
573 aa  832    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.35 
 
 
572 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1249  methyl-accepting chemotaxis protein  56.08 
 
 
596 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000483868  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 
543 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 
552 aa  310  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 
552 aa  310  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.02 
 
 
547 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.77 
 
 
637 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 
549 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.77 
 
 
638 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.71 
 
 
636 aa  263  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47 
 
 
638 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  42.94 
 
 
629 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.59 
 
 
638 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.43 
 
 
679 aa  259  8e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  44.15 
 
 
647 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.36 
 
 
674 aa  256  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.46 
 
 
550 aa  256  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.65 
 
 
640 aa  256  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 
638 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.06 
 
 
638 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.65 
 
 
541 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 
673 aa  251  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 
570 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  40.84 
 
 
712 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  42.07 
 
 
642 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 
653 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 
653 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 
541 aa  246  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  41.6 
 
 
653 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.62 
 
 
640 aa  246  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
637 aa  246  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.42 
 
 
675 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 
674 aa  246  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  46.35 
 
 
647 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.49 
 
 
522 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  40.21 
 
 
712 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.4 
 
 
647 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  40.46 
 
 
633 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.3 
 
 
638 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 
642 aa  244  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  37.44 
 
 
546 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 
619 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  43.1 
 
 
639 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 
552 aa  243  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  42.22 
 
 
638 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 
647 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.03 
 
 
716 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0859  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 
673 aa  240  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.34 
 
 
739 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
674 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  38.89 
 
 
541 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 
542 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 
572 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  35.49 
 
 
640 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
605 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.27 
 
 
673 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.27 
 
 
673 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.27 
 
 
673 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.27 
 
 
673 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  38.88 
 
 
546 aa  237  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
544 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 
673 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 
673 aa  236  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
681 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 
541 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.3 
 
 
634 aa  236  8e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  42.12 
 
 
541 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.41 
 
 
523 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 
438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
640 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  38.05 
 
 
541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  41.74 
 
 
634 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 
647 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.27 
 
 
773 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 
673 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.28 
 
 
552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.16 
 
 
541 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 
713 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.96 
 
 
650 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  42.69 
 
 
541 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 
539 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.69 
 
 
542 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  46.56 
 
 
541 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 
634 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.17 
 
 
673 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.990285  normal  0.659639 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  38.72 
 
 
546 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.12 
 
 
541 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  37.53 
 
 
541 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  39.04 
 
 
541 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 
675 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.547128  hitchhiker  0.00024543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  40.51 
 
 
676 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 
639 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  43.91 
 
 
541 aa  232  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.07 
 
 
541 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.97 
 
 
647 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.32 
 
 
541 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>