More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4160 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 
762 aa  1565    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  66.34 
 
 
854 aa  942    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  50.09 
 
 
652 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  42.19 
 
 
703 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  44.62 
 
 
430 aa  345  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  42.89 
 
 
400 aa  325  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  44.47 
 
 
559 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  43.63 
 
 
425 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  41.78 
 
 
675 aa  301  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  42 
 
 
763 aa  298  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  38.94 
 
 
451 aa  287  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  42.92 
 
 
521 aa  283  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  37.62 
 
 
662 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  38.27 
 
 
439 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  40.65 
 
 
414 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  38.59 
 
 
586 aa  267  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  39.59 
 
 
455 aa  253  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  33.95 
 
 
472 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  30.76 
 
 
997 aa  218  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  36.12 
 
 
540 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  34.6 
 
 
540 aa  217  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  33.55 
 
 
1271 aa  217  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  35.63 
 
 
536 aa  216  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  36.26 
 
 
651 aa  216  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  36.26 
 
 
539 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  37.7 
 
 
542 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  34.09 
 
 
792 aa  208  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  35.96 
 
 
532 aa  204  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 
674 aa  201  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  31.52 
 
 
674 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  32.02 
 
 
674 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  31.52 
 
 
674 aa  198  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  32.02 
 
 
674 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  31.74 
 
 
674 aa  197  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.8 
 
 
674 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.8 
 
 
674 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.8 
 
 
674 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  31.8 
 
 
674 aa  196  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  32.19 
 
 
484 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 
674 aa  188  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  29.6 
 
 
639 aa  187  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  29.01 
 
 
868 aa  173  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  29.07 
 
 
867 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  31.52 
 
 
869 aa  172  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  30.96 
 
 
868 aa  171  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  31.67 
 
 
848 aa  171  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 
868 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  28.68 
 
 
868 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 
868 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  29.16 
 
 
1080 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  29.32 
 
 
868 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  28.75 
 
 
373 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  29.98 
 
 
482 aa  160  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  28.46 
 
 
972 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  28.75 
 
 
377 aa  156  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  28.73 
 
 
863 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  30.89 
 
 
563 aa  155  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  29.5 
 
 
848 aa  151  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  29.76 
 
 
855 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  32.18 
 
 
396 aa  148  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  29.02 
 
 
463 aa  147  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  29.72 
 
 
398 aa  144  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  30.07 
 
 
388 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  30.2 
 
 
372 aa  137  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 
652 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  37.22 
 
 
613 aa  134  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  28.97 
 
 
431 aa  134  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 
1578 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 
355 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  29.27 
 
 
401 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  31.47 
 
 
382 aa  124  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  26.14 
 
 
861 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  27.59 
 
 
505 aa  120  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.32 
 
 
809 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  26.46 
 
 
407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 
1129 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  36.15 
 
 
552 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  35.94 
 
 
680 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  42.31 
 
 
743 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 
1127 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  25 
 
 
1127 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  27.11 
 
 
634 aa  108  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  24.95 
 
 
1127 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  24.76 
 
 
1127 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  24.49 
 
 
1146 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  35.71 
 
 
464 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  35.16 
 
 
465 aa  105  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  26.33 
 
 
1054 aa  105  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  37.11 
 
 
455 aa  104  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  37.11 
 
 
455 aa  104  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  24.2 
 
 
1053 aa  104  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  26.43 
 
 
1782 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  37.11 
 
 
455 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  35.71 
 
 
455 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  24.08 
 
 
657 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
459 aa  103  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  28.57 
 
 
1362 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  36.27 
 
 
456 aa  102  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  35.71 
 
 
455 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  34.34 
 
 
455 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>