More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1633 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
503 aa  983    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  54.22 
 
 
507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  55.11 
 
 
502 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.17 
 
 
519 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  38.7 
 
 
519 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  39.3 
 
 
509 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.2 
 
 
534 aa  284  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.74 
 
 
607 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 
520 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.24 
 
 
522 aa  276  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.03 
 
 
532 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 
522 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.89 
 
 
520 aa  260  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 
555 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 
511 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.95 
 
 
503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.8 
 
 
531 aa  255  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.19 
 
 
525 aa  253  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 
528 aa  250  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 
518 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2521  major facilitator transporter  38.37 
 
 
497 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 
517 aa  243  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 
516 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 
513 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 
486 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 
486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 
486 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 
486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 
486 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 
486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 
521 aa  239  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.85 
 
 
538 aa  239  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.45 
 
 
525 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 
509 aa  238  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.33 
 
 
516 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 
537 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 
508 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.35 
 
 
518 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 
588 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  36.38 
 
 
528 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  33.81 
 
 
525 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  33.81 
 
 
525 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  33.81 
 
 
525 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.59 
 
 
502 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 
516 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  37.22 
 
 
554 aa  230  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.83 
 
 
478 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.58 
 
 
478 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  33.27 
 
 
533 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  34.31 
 
 
533 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 
509 aa  226  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.36 
 
 
478 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.36 
 
 
484 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  34.1 
 
 
517 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  33.92 
 
 
526 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.91 
 
 
493 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 
517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.51 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 
609 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  33.33 
 
 
503 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 
523 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 
524 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.1 
 
 
626 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 
458 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  34.27 
 
 
584 aa  220  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.95 
 
 
485 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.18 
 
 
646 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.18 
 
 
646 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 
532 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 
646 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 
534 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 
512 aa  216  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 
562 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.06 
 
 
478 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 
513 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 
521 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  36.29 
 
 
505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2542  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 
485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 
488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5160  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.74 
 
 
509 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 
505 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
500 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.68 
 
 
458 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.82 
 
 
487 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  35.22 
 
 
509 aa  210  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 
525 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  31.62 
 
 
536 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.39 
 
 
469 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  30.46 
 
 
579 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.34 
 
 
478 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 
468 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1007  major facilitator transporter  32.55 
 
 
536 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1024  major facilitator superfamily transporter  32.55 
 
 
536 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.73 
 
 
487 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 
510 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1034  major facilitator transporter  32.55 
 
 
536 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  31.72 
 
 
495 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31 
 
 
505 aa  206  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.56 
 
 
489 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>