More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1467 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
217 aa  434  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
208 aa  66.6  3e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
207 aa  65.1  9e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
195 aa  64.3  1e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
211 aa  63.5  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
202 aa  61.6  8e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
202 aa  61.2  1e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
202 aa  61.2  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
202 aa  61.2  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
202 aa  61.2  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 
237 aa  60.8  1e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
202 aa  61.2  1e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 
194 aa  60.8  2e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 
231 aa  59.7  3e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 
199 aa  60.1  3e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.49 
 
 
217 aa  58.9  5e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
191 aa  58.9  6e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 
201 aa  58.2  8e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1746  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
225 aa  57.8  1e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 
221 aa  57.8  1e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 
211 aa  57.8  1e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  18.56 
 
 
200 aa  58.2  1e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.7358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1727  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
225 aa  57.8  1e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113561  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1793  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
225 aa  57.8  1e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
192 aa  57  2e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
210 aa  57.4  2e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 
195 aa  57  2e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 
202 aa  57.4  2e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
204 aa  57.4  2e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.29 
 
 
216 aa  57  2e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
212 aa  57  2e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
195 aa  57  2e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 
210 aa  57  2e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
210 aa  56.2  3e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
212 aa  56.6  3e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
201 aa  56.2  3e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
215 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
202 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
202 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
215 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
215 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
198 aa  56.2  4e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
202 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
212 aa  56.2  4e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 
193 aa  56.2  4e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  49.18 
 
 
198 aa  56.2  4e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
209 aa  56.2  4e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 
197 aa  55.5  5e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 
191 aa  55.5  6e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
210 aa  55.5  6e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
210 aa  55.5  6e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 
226 aa  55.5  7e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
207 aa  55.1  7e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
199 aa  55.1  7e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
205 aa  55.1  8e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 
202 aa  54.7  9e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
211 aa  54.7  1e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28 
 
 
215 aa  54.3  1e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
215 aa  54.3  1e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 
204 aa  54.7  1e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 
202 aa  54.3  1e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  46.48 
 
 
219 aa  54.3  1e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  4.53712e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  29.8 
 
 
346 aa  54.3  1e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
213 aa  54.7  1e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
214 aa  54.7  1e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 
201 aa  54.3  1e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  28 
 
 
215 aa  54.3  1e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28 
 
 
215 aa  54.3  1e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  28 
 
 
215 aa  54.3  1e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  41.1 
 
 
196 aa  54.7  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28 
 
 
215 aa  54.3  1e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28 
 
 
215 aa  54.3  1e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28 
 
 
215 aa  54.3  1e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28 
 
 
215 aa  54.3  1e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
201 aa  53.5  2e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  44.07 
 
 
197 aa  53.9  2e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  44.44 
 
 
194 aa  54.3  2e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 
196 aa  53.9  2e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
196 aa  54.3  2e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
200 aa  53.5  2e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
245 aa  53.5  2e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
209 aa  53.9  2e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
205 aa  53.5  2e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
219 aa  53.1  3e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  49.12 
 
 
201 aa  53.1  3e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
224 aa  53.1  3e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.27 
 
 
217 aa  53.1  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.27 
 
 
217 aa  53.1  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.27 
 
 
217 aa  53.1  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
205 aa  53.1  3e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.27 
 
 
217 aa  53.1  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
195 aa  53.1  3e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.27 
 
 
217 aa  53.1  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38380  putative transcriptional regulator  33.86 
 
 
210 aa  53.1  3e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0126427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
202 aa  52.8  4e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 
207 aa  52.8  4e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  31.74 
 
 
326 aa  52.8  4e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.552525 
 
 
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NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 
239 aa  52.8  4e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
202 aa  52.8  4e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  51.72 
 
 
202 aa  52.8  4e-06  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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