129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  100 
 
 		 414 aa  806    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  56.61 
 
 		 392 aa  463  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  58.4 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 386 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  50.86 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  53.19 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  49.12 
 
 		 393 aa  375  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  45.79 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  46.78 
 
 		 388 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 395 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  28.31 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  23.69 
 
 		 505 aa  72.8  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  23.12 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  21.41 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  25.71 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  25.76 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  28.03 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  26.3 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 429 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 486 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  22.14 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  20.11 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  26.44 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  19.84 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1999  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000199597  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  30.77 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8922  Arabinose efflux permease-like protein  27.84 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  31.21 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 398 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  25.99 
 
 		 393 aa  46.6  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  31.21 
 
 		 378 aa  46.6  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  31.21 
 
 		 378 aa  46.6  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  31.21 
 
 		 378 aa  46.6  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  31.21 
 
 		 378 aa  46.6  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  31.21 
 
 		 378 aa  46.6  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  31.21 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  24.16 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  25.23 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 376 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>