179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1999 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1999  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 424 aa  777    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000199597  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3597  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2486  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0828  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 385 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0218  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.851402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 470 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 394 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  28.17 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  28.17 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  28.17 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  27.91 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  27.58 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  27.58 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  27.58 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  27.58 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  27.58 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  29.4 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  30.68 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  27.64 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  24.93 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  25.49 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  21.3 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  30.69 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  27.96 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  24.79 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  27.96 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  26.8 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  26.65 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  30.33 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  25.27 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  28.42 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2631  twin-arginine translocation pathway signal  34.29 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.774949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  33.53 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  25.65 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  26.74 
 
 		 384 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1120  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 396 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  27.05 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>