More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2001 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  98.5 
 
 
867 aa  1745  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  100 
 
 
867 aa  1771  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  98.96 
 
 
867 aa  1754  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  73.59 
 
 
866 aa  1306  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  98.5 
 
 
867 aa  1746  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 
855 aa  406  1e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 
847 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 
857 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 
852 aa  401  1e-110  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.04176e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 
861 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.24466e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 
861 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.1652e-05  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 
861 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.02099e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 
875 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 
861 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 
861 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 
861 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 
871 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 
849 aa  389  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  7.02632e-05  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 
869 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  32.98 
 
 
827 aa  350  6e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 
891 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 
890 aa  308  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 
890 aa  304  5e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 
890 aa  303  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 
895 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 
896 aa  299  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 
869 aa  300  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.50471e-05  decreased coverage  5.82733e-08 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 
874 aa  295  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 
842 aa  295  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 
868 aa  294  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.98241e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 
872 aa  291  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  28.04 
 
 
922 aa  290  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.71 
 
 
884 aa  290  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  26.86 
 
 
899 aa  286  1e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 
909 aa  284  6e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 
909 aa  283  7e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 
843 aa  282  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 
883 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 
876 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  9.50091e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 
883 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 
896 aa  280  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  27.85 
 
 
880 aa  279  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 
879 aa  279  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  27.26 
 
 
893 aa  278  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 
883 aa  277  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 
841 aa  275  2e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
950 aa  273  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
924 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
924 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
924 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 
836 aa  271  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 
925 aa  271  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 
901 aa  270  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 
853 aa  267  6e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  3.33969e-09 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28.54 
 
 
936 aa  265  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 
853 aa  264  7e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 
853 aa  264  7e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  29.61 
 
 
839 aa  263  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 
853 aa  263  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
928 aa  263  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 
930 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  5.15529e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 
930 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 
930 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 
838 aa  259  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 
817 aa  258  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 
800 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  29.49 
 
 
853 aa  258  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 
904 aa  257  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 
1055 aa  256  1e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
927 aa  256  2e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 
869 aa  254  5e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 
904 aa  254  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
904 aa  253  8e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 
855 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.10647e-05  hitchhiker  9.76809e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 
904 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 
855 aa  251  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 
884 aa  246  1e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
912 aa  246  2e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.22801e-05  decreased coverage  5.339e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  28 
 
 
924 aa  245  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 
944 aa  243  8e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 
965 aa  236  1e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.38952e-05  decreased coverage  6.0064e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 
907 aa  236  2e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  1.65135e-05 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  27.8 
 
 
834 aa  235  2e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
941 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
941 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 
903 aa  231  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
941 aa  231  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 
894 aa  231  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  28.04 
 
 
866 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
873 aa  230  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  2.19382e-05 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
935 aa  229  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 
910 aa  225  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 
991 aa  225  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 
897 aa  224  5e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 
873 aa  223  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  9.66582e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 
886 aa  221  4e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 
912 aa  219  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 
886 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 
935 aa  218  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
882 aa  217  6e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>