More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25370 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  54.77 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.49 
 
 		 222 aa  191  7e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.32 
 
 		 229 aa  161  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  38.92 
 
 		 212 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  36.89 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  37.38 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  36.63 
 
 		 217 aa  121  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.27 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.57 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.04 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.14 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  36.41 
 
 		 258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  37.57 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  37.29 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.14 
 
 		 211 aa  107  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  37.11 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  36.54 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.92 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  37.57 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  34.63 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  37.31 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.89 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  36.6 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  35.29 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 		 251 aa  99  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  33.68 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.62 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  34.63 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  33.66 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.51 
 
 		 574 aa  97.8  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  35.78 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 		 208 aa  97.1  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  34.84 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.16 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  33.89 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  33.89 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  36.7 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  34.9 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  35.79 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  31.63 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  32.78 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  33.33 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 		 209 aa  94.7  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 		 202 aa  94.7  9e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 295 aa  94  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  31.14 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  33.15 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.69 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  34.44 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  30.92 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>