More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2671 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  43.51 
 
 		 920 aa  740    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  64.27 
 
 		 921 aa  1209    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  65.18 
 
 		 915 aa  1255    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  64.29 
 
 		 920 aa  1258    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  40.69 
 
 		 897 aa  665    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  65.31 
 
 		 919 aa  1234    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  100 
 
 		 919 aa  1866    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  63.81 
 
 		 912 aa  1206    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  60.41 
 
 		 922 aa  1171    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  63.71 
 
 		 931 aa  1233    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  69.1 
 
 		 910 aa  1331    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  37.59 
 
 		 869 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  38.67 
 
 		 869 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  44.35 
 
 		 828 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  43.81 
 
 		 828 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  44.65 
 
 		 827 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  36.57 
 
 		 852 aa  586  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  44.05 
 
 		 828 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  43.34 
 
 		 837 aa  581  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  43.34 
 
 		 837 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  43.21 
 
 		 837 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  31.91 
 
 		 833 aa  355  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  27.92 
 
 		 948 aa  295  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  34.36 
 
 		 753 aa  263  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  32.04 
 
 		 1055 aa  263  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  31.34 
 
 		 781 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  27.74 
 
 		 830 aa  234  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 834 aa  234  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  28.2 
 
 		 977 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 833 aa  226  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  29.91 
 
 		 952 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  27.99 
 
 		 869 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  27.74 
 
 		 812 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  32.94 
 
 		 779 aa  221  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 846 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  26.43 
 
 		 824 aa  210  8e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  32.05 
 
 		 936 aa  206  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  33.79 
 
 		 940 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  27.97 
 
 		 823 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  29.5 
 
 		 791 aa  202  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  30.38 
 
 		 800 aa  197  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 830 aa  194  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.29 
 
 		 877 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  34.19 
 
 		 849 aa  191  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.46 
 
 		 877 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  29.26 
 
 		 875 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.46 
 
 		 800 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  30.35 
 
 		 803 aa  188  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  37.04 
 
 		 576 aa  188  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  31.89 
 
 		 947 aa  186  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  36.78 
 
 		 568 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  29.93 
 
 		 580 aa  127  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  30.12 
 
 		 478 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  39.01 
 
 		 425 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.86 
 
 		 473 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.77 
 
 		 552 aa  107  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.77 
 
 		 552 aa  99.8  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  28.25 
 
 		 579 aa  99  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30 
 
 		 552 aa  99  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 605 aa  99  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30 
 
 		 552 aa  98.6  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  25.48 
 
 		 495 aa  97.8  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25.21 
 
 		 495 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 508 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  23.7 
 
 		 609 aa  94  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  23.18 
 
 		 700 aa  93.2  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  24.42 
 
 		 495 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  26.2 
 
 		 516 aa  92  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  26.27 
 
 		 603 aa  92.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  25.68 
 
 		 362 aa  91.3  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.64 
 
 		 703 aa  89.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  29.03 
 
 		 587 aa  89  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  23.79 
 
 		 700 aa  89  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  24.1 
 
 		 551 aa  88.6  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  26.91 
 
 		 358 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  24.62 
 
 		 351 aa  87.8  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  25.6 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  26.76 
 
 		 606 aa  84.7  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  26.89 
 
 		 379 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  26.61 
 
 		 431 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 386 aa  83.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  25.37 
 
 		 558 aa  84  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  27.69 
 
 		 282 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  28.18 
 
 		 347 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  25.93 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.48 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  26.49 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  24.78 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.46 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  27.39 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 205 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  23.26 
 
 		 264 aa  79.7  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  27.41 
 
 		 268 aa  79.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  24.61 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  24.77 
 
 		 270 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 252 aa  79  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1959  polysaccharide export protein  27.33 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.015315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>