More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1196 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
287 aa  607  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  99.65 
 
 
287 aa  606  1e-172  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  99.65 
 
 
287 aa  606  1e-172  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  99.65 
 
 
287 aa  605  1e-172  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  63.44 
 
 
287 aa  381  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  34.06 
 
 
288 aa  188  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 
289 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 
293 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  35.97 
 
 
291 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 
301 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
251 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  6.97123e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  35.13 
 
 
293 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  34.78 
 
 
324 aa  184  1e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 
315 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 
315 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 
315 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  3.94258e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 
291 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 
332 aa  182  4e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 
315 aa  182  4e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 
293 aa  182  8e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
311 aa  179  3e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
311 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
311 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 
678 aa  179  6e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  5.1538e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
327 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
311 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 
311 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
305 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  35.47 
 
 
305 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  35.47 
 
 
305 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 
291 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 
322 aa  174  2e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  36.12 
 
 
291 aa  172  7e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 
306 aa  172  7e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 
291 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.13 
 
 
291 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 
346 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  35.91 
 
 
287 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 
291 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
311 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
311 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 
290 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 
293 aa  163  2e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 
291 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 
291 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 
289 aa  158  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 
304 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  30.2 
 
 
310 aa  129  4e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 
305 aa  115  1e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5208  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 
314 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 
309 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  27.03 
 
 
297 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  28.5 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 
318 aa  93.2  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  43.88 
 
 
296 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.96 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  29.22 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
301 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 
278 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 
305 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 
305 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
278 aa  85.9  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 
305 aa  85.1  1e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
314 aa  84.3  2e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 
300 aa  84  2e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 
306 aa  84.3  2e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 
278 aa  84  2e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 
299 aa  83.2  5e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 
513 aa  83.2  5e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 
272 aa  83.2  5e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  26.39 
 
 
289 aa  82.8  6e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  36.7 
 
 
180 aa  82.4  7e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  25.35 
 
 
299 aa  82.4  7e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
274 aa  82.4  8e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  34.51 
 
 
275 aa  81.6  1e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 
297 aa  82  1e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
279 aa  82  1e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
279 aa  82  1e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  5.37916e-12  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  31.06 
 
 
336 aa  81.3  2e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  29.61 
 
 
293 aa  81.3  2e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  31.13 
 
 
300 aa  80.5  3e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  31.64 
 
 
294 aa  80.5  3e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4441  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 
300 aa  80.5  3e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.440571  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4555  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 
315 aa  80.5  3e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 
278 aa  80.5  3e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 
318 aa  80.5  3e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>