More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2955 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 250 aa  510  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  64.22 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  64.22 
 
 		 236 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  63.76 
 
 		 236 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  63.76 
 
 		 236 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  62.27 
 
 		 223 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  60.45 
 
 		 223 aa  279  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  60.45 
 
 		 223 aa  279  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  60 
 
 		 223 aa  278  9e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 223 aa  277  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  61.93 
 
 		 222 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  61.09 
 
 		 221 aa  268  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  57.59 
 
 		 234 aa  264  8e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  58.64 
 
 		 222 aa  265  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  56.54 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  54.5 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  54.73 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  48.17 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  51.9 
 
 		 217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  50 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  49.77 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  48.61 
 
 		 218 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  46.54 
 
 		 229 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  47.71 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  51.26 
 
 		 222 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  49.32 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  49.77 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  46.79 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.09 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  45.83 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  43.52 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  49.07 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01332  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  46.08 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  44.39 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  41.44 
 
 		 250 aa  178  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  45.29 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  48.28 
 
 		 220 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  41.36 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  39.19 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  42.23 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  41.1 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  44.09 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  46.3 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  44.05 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  44.14 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  45.83 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 248 aa  171  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  38.1 
 
 		 293 aa  171  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  43.44 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  39.73 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  40.62 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  43.2 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  44.39 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  42.6 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  40.36 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  44.39 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  42.34 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  41.07 
 
 		 229 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  46.54 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  41.07 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  41.44 
 
 		 277 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  46.54 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3735  ABC transporter related  44.44 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3052  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  39.63 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  39.91 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  42.27 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0064  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  41.78 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>