More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0063 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 408 aa  814    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  96.94 
 
 		 364 aa  697    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 462 aa  96.7  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  20.81 
 
 		 535 aa  93.6  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.09 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 458 aa  90.1  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.36 
 
 		 441 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  19.07 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.56 
 
 		 471 aa  83.2  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 496 aa  82.8  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.57 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  20.53 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.01 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  22.95 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  20.19 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  20.78 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  20.7 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  22.46 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.1 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1581  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.77 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  20.72 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  20.96 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  18.82 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  20.98 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  20.38 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  20.67 
 
 		 1496 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2299  outer membrane efflux protein  21.89 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  20.5 
 
 		 485 aa  67  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  20.34 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  20.77 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  20.33 
 
 		 576 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  20.18 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  20.19 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.06 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  21.73 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  20.76 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  19.47 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  22.73 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  22.9 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.17 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  21.31 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  19.56 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 444 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  18.98 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  20.53 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  20.53 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.73 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00474819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  22.02 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  20.4 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  19.9 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.41 
 
 		 503 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  22 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  20.33 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  22.91 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  22.91 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.97 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.97 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  20.18 
 
 		 972 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  21.29 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  21.35 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  19.91 
 
 		 457 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  20.87 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.11 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1359  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  20.35 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  20.73 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  21.29 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.89 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  23.24 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  20.85 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  22.91 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  25.32 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  18.9 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.19 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  20.81 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  19.95 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>