More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1973 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 203 aa  413  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  95.57 
 
 		 203 aa  396  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  87.19 
 
 		 203 aa  370  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  68.97 
 
 		 224 aa  305  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  71.14 
 
 		 201 aa  304  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  68.81 
 
 		 203 aa  296  1e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  66.5 
 
 		 262 aa  278  3e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  67.16 
 
 		 200 aa  269  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  66.17 
 
 		 200 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 200 aa  268  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  66.67 
 
 		 200 aa  268  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 200 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 200 aa  267  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 200 aa  267  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 200 aa  267  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 200 aa  267  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 200 aa  267  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 200 aa  267  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  65.17 
 
 		 200 aa  265  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  65.17 
 
 		 200 aa  265  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 200 aa  263  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 200 aa  263  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  62.69 
 
 		 200 aa  251  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  54.11 
 
 		 208 aa  228  4e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 208 aa  220  9e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  53.81 
 
 		 208 aa  204  9e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  54.76 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  54.76 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  52.86 
 
 		 208 aa  201  7e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  54.29 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  50 
 
 		 201 aa  198  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  52.38 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  51.46 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  52.86 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  50.97 
 
 		 205 aa  194  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  50.98 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  48.51 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 201 aa  191  9e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 208 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 207 aa  184  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  47.14 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  51.23 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  47.26 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  47.14 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  45.54 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  48.1 
 
 		 208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0397  30S ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  45.24 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0405  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.916178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2302  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.23 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3924  30S ribosomal protein S4  48.82 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  177  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>