More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3658 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 386 aa  757    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  43.2 
 
 		 385 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  44.92 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  44.05 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  39.62 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  42.51 
 
 		 387 aa  288  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.39 
 
 		 377 aa  285  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.34 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  40.05 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  36.56 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.71 
 
 		 341 aa  268  8e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 		 396 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.89 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  40.53 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  37.94 
 
 		 371 aa  248  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  43.36 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  37.36 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  40.1 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 		 389 aa  206  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  35.75 
 
 		 382 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  40.41 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  40.72 
 
 		 387 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  37.07 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  36.46 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  47.11 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 		 378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 		 378 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 		 382 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.77 
 
 		 378 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.77 
 
 		 378 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.77 
 
 		 385 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.77 
 
 		 385 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.77 
 
 		 385 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.77 
 
 		 385 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.77 
 
 		 385 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.77 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 		 379 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  28 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  28.37 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  38.12 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 373 aa  182  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  31.94 
 
 		 371 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  34.06 
 
 		 381 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  26.08 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  41.16 
 
 		 379 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  25.81 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 375 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  35.09 
 
 		 598 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  29.57 
 
 		 371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 379 aa  152  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.35 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  27.72 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  25.87 
 
 		 370 aa  145  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  23.34 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  25 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  25 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  25.27 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  24.19 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.14 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 		 348 aa  96.3  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 379 aa  93.6  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  36.56 
 
 		 371 aa  92.8  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>