100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1478 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  100 
 
 		 838 aa  1736    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  46.29 
 
 		 1088 aa  719    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  39.36 
 
 		 882 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  29.4 
 
 		 816 aa  183  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  31.99 
 
 		 792 aa  168  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.63 
 
 		 1170 aa  132  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1104 aa  132  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1210 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1298 aa  102  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  29.67 
 
 		 1159 aa  94.4  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  24.81 
 
 		 1252 aa  90.1  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.94 
 
 		 1194 aa  89.4  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  29.41 
 
 		 1132 aa  88.2  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  24.87 
 
 		 1257 aa  87.8  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  24.87 
 
 		 1244 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1177 aa  85.9  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1178 aa  85.5  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1120 aa  83.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  23.9 
 
 		 1089 aa  82.4  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  23.56 
 
 		 1256 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1338 aa  80.1  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1154 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1209 aa  79.3  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1290 aa  78.2  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1282 aa  75.1  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  24.65 
 
 		 955 aa  74.7  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1243 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1363 aa  73.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1039 aa  72.8  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  25 
 
 		 1147 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1339 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1339 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  24.94 
 
 		 1186 aa  70.9  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  34.51 
 
 		 995 aa  70.5  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1338 aa  70.5  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1441 aa  68.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  26.46 
 
 		 1432 aa  68.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1366 aa  68.2  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1347 aa  67.4  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1184 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.16 
 
 		 1041 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1426 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  23.94 
 
 		 1076 aa  66.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1461 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1299 aa  65.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  28.57 
 
 		 1058 aa  63.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1365 aa  63.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1452 aa  62.4  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1347 aa  62.4  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1324 aa  62  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1339 aa  61.6  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  29.93 
 
 		 1020 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1036 aa  60.1  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1333 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  27.64 
 
 		 1318 aa  58.9  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.97 
 
 		 1277 aa  58.2  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  21.59 
 
 		 1278 aa  57.4  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  29.01 
 
 		 1336 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1022 aa  57  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1375 aa  57  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1581 aa  57  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1497 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1346 aa  55.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1612 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  31.75 
 
 		 974 aa  54.7  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  24.17 
 
 		 1343 aa  54.7  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1342 aa  54.7  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.99 
 
 		 836 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1440 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  30.15 
 
 		 950 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1373 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1425 aa  52.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.03 
 
 		 1338 aa  52.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1098 aa  51.6  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1250 aa  51.6  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  29.01 
 
 		 1319 aa  51.6  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  28.91 
 
 		 1358 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1572 aa  50.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  28.15 
 
 		 1354 aa  51.2  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  23.27 
 
 		 1322 aa  50.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1422 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1250 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1188 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1575 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  28.15 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1409 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  27.48 
 
 		 1306 aa  47.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  29.46 
 
 		 846 aa  47.8  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1241 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1359 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  22.59 
 
 		 1331 aa  47  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  25.97 
 
 		 869 aa  46.6  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  28.24 
 
 		 1355 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1459 aa  45.8  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1353 aa  46.2  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1321 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  26.92 
 
 		 1581 aa  45.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1430 aa  45.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1484 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.49 
 
 		 1573 aa  44.3  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>