157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1458 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.82 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  41.43 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  31.7 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  29.41 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  26.89 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  27.43 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  28 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  27.56 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  24.31 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  25.79 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  25.91 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  31.2 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  36.21 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  29.24 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  37.63 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  29.91 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.78 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.57 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  27.18 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.31 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.81 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  27.8 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.52 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  30.08 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  22 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.48 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  26.32 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.43 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  22.73 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  26.79 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  22 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.83 
 
 		 312 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  22 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  22 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  28.36 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  22 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  22 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  22 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  32.32 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  31.68 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.8 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  28.28 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  25.12 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  24.51 
 
 		 295 aa  52.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.29 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.19 
 
 		 272 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.17 
 
 		 536 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  22.08 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.89 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  30.63 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  31.51 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.56 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  31.03 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  23.2 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.09 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.06 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.29 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4312  sugar phosphate isomerases/epimerases  34.62 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.517232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.23 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  28.05 
 
 		 326 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.69 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  25.62 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  28.75 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  27.17 
 
 		 289 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.78 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1208  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.32 
 
 		 309 aa  48.9  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0407  xylose isomerase domain-containing protein  31.21 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  26.01 
 
 		 295 aa  48.5  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  27.45 
 
 		 242 aa  48.9  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  35.71 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  30.4 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  35.21 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  27.63 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  26.27 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  25.5 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  32.39 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  23.3 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  29.8 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  31.96 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  28.24 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  23.58 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  27.63 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  33.71 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  25.35 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  22.22 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  23.18 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  26.35 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.29 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  24.76 
 
 		 292 aa  46.2  0.0005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.24 
 
 		 339 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  29.27 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.71 
 
 		 305 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  34.15 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.03 
 
 		 294 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>