More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5064 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 
242 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  88.84 
 
 
242 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  71.9 
 
 
284 aa  345  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  58.9 
 
 
299 aa  251  8e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
255 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  44.3 
 
 
250 aa  172  6e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  45.5 
 
 
249 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
234 aa  158  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  42.11 
 
 
246 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  43.83 
 
 
236 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  44.16 
 
 
236 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
251 aa  140  1e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  37.82 
 
 
273 aa  139  5e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 
268 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  40.27 
 
 
237 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  42.79 
 
 
249 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 
249 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  38.46 
 
 
262 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  38.79 
 
 
273 aa  135  7e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  9.57079e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  39.55 
 
 
237 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
270 aa  134  2e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
240 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
254 aa  132  7e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
274 aa  131  8e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  41.48 
 
 
249 aa  131  8e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
248 aa  130  2e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  41.05 
 
 
249 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 
244 aa  128  7e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
268 aa  128  7e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  36.75 
 
 
272 aa  128  1e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  41.38 
 
 
255 aa  126  2e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  39.24 
 
 
249 aa  127  2e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  39.56 
 
 
238 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  40.52 
 
 
252 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  39.56 
 
 
251 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
247 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  40.76 
 
 
232 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  37.78 
 
 
251 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
245 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  36.73 
 
 
248 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  37.17 
 
 
246 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
247 aa  121  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
237 aa  121  1e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
247 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  40.54 
 
 
247 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
272 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  38.43 
 
 
253 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  36.4 
 
 
248 aa  115  7e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  37.83 
 
 
249 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  37.83 
 
 
249 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  37.83 
 
 
249 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  36.99 
 
 
243 aa  111  8e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
249 aa  111  8e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
253 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3401  GntR domain-containing protein  41.2 
 
 
233 aa  111  1e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334761  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
252 aa  111  1e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  37.39 
 
 
253 aa  111  1e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.92 
 
 
241 aa  110  2e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  36.64 
 
 
253 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  36.64 
 
 
253 aa  109  4e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
251 aa  108  9e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  32.48 
 
 
266 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  40.58 
 
 
242 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.49 
 
 
240 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  38.65 
 
 
235 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  40.76 
 
 
233 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  40.76 
 
 
233 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  39.01 
 
 
244 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
259 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  8.56086e-05  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.21 
 
 
264 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
252 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.96 
 
 
243 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  34.88 
 
 
234 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  34.39 
 
 
247 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  34.39 
 
 
247 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  34.39 
 
 
247 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  8.58772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  38.16 
 
 
234 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
246 aa  99.4  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  34.22 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
246 aa  99.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
234 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  34.98 
 
 
225 aa  98.6  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.83 
 
 
238 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  34.21 
 
 
234 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  35.68 
 
 
236 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  36.1 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.63165e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  33.48 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  33.64 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  33.18 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  35.53 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  33.2 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  31.25 
 
 
218 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
288 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  39.76 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>