More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2928 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 241 aa  500  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  97.1 
 
 		 241 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2028  LuxR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  31.44 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  30.49 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3102  LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.644499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  30.52 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 268 aa  88.6  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  32 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  28.69 
 
 		 307 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  31.46 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  28.69 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4147  transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  31.47 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  28.93 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  27.31 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  27.47 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1709  transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  27.47 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  28.5 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  28.04 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  28.9 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.9 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  26.53 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.9 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.9 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  26.37 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.9 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.9 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.9 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.9 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5910  LuxR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0531603  decreased coverage  0.00148471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  28.35 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.81 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.65 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  37.21 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.65 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  27.85 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.65 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.65 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  28.26 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  27.54 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  28.88 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.54 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4641  LuxR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.05 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.05 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.05 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  26.46 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.05 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  29.79 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.05 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3348  transcriptional regulator, LuxR family  25.51 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.05 
 
 		 394 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>