80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1709 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1709  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 240 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3102  LuxR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.644499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2028  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  25.66 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  30.81 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  30.81 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3348  transcriptional regulator, LuxR family  29.12 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  24.64 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8140  transcriptional regulator TraR  27.51 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692827  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8300  transcriptional regulator TraR  27.72 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  27.45 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9195  transcriptional regulator TraR  24.87 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.391185  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0694  transcriptional regulator, LuxR family  25.55 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4428  transcriptional regulator, LuxR family  22.27 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  24.86 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  24.74 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  24.89 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  25.79 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  26.73 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  26.32 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  19.63 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  26.03 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  22.52 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  22.52 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.8 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4889  autoinducer-binding domain-containing protein  27.08 
 
 		 233 aa  45.4  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70592  normal  0.843155 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  24.36 
 
 		 260 aa  45.4  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4147  transcriptional regulator, LuxR family  19.91 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5493  transcriptional regulator, LuxR family  23.62 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  22.51 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  21.58 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  22.51 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  22.51 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  22.51 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  22.51 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  22.51 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4067  hypothetical protein  29.11 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.297219 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  22.51 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  19.64 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  21.94 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  24.29 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  21.52 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>