More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2372 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  55.79 
 
 		 192 aa  228  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  54.74 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 195 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 188 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 188 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  34.09 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  30.29 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 189 aa  98.6  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  29.31 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 188 aa  91.3  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 187 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 167 aa  88.2  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  29.14 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 165 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  28 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 600 aa  81.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  22.47 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  26.6 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  26.19 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
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