More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1260 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  79.74 
 
 		 233 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  46.75 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  49.58 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1596  GntR domain-containing protein  46.32 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387143  hitchhiker  0.00000232868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  44.16 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  42.13 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  37.71 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 247 aa  134  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  37.23 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  38.67 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  34.48 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.53 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  36.77 
 
 		 238 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  36.77 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  37.33 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  34.96 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  34.98 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  37.78 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  34.45 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  34.31 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  36.91 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  36.44 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  35.53 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  37.66 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.92 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.4 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.36 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  34.52 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.92 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.06 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  34.75 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.17 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  33.03 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1789  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 232 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.33 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  34.76 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  34.35 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  32.17 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  34.06 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  32.89 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  34.07 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  32.89 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 240 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  40.94 
 
 		 245 aa  101  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  34.07 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  33.48 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.58 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  33.91 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  32.11 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  34.35 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  35.98 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  32.43 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  33.91 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  29.6 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.89 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.5 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  34.5 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.04 
 
 		 263 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  34.5 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  34.5 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  34.5 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  34.5 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  34.5 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  34.5 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>