More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2028 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  91.09 
 
 		 348 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 352 aa  714    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  68.33 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  51.76 
 
 		 340 aa  358  9e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  48.98 
 
 		 360 aa  352  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  50.15 
 
 		 351 aa  351  8.999999999999999e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  52.48 
 
 		 345 aa  349  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  53.51 
 
 		 345 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  48.69 
 
 		 340 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  49.71 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  46.67 
 
 		 340 aa  322  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 355 aa  322  7e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  46.96 
 
 		 340 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  47.51 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  47.51 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  47.51 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  47.51 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  47.51 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  47.51 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  47.51 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  46.22 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  50.15 
 
 		 361 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  47.21 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  47.21 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  47.81 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  46.51 
 
 		 348 aa  315  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  45.95 
 
 		 359 aa  315  7e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  45.64 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  46.22 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  46.2 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 		 401 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  45.91 
 
 		 339 aa  309  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  44.8 
 
 		 351 aa  309  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  45.8 
 
 		 351 aa  308  8e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  46.2 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  43.4 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  43.4 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  47.09 
 
 		 357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  44.22 
 
 		 351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  44.19 
 
 		 352 aa  302  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  47.95 
 
 		 371 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  43.64 
 
 		 351 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  43.35 
 
 		 351 aa  302  7.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  43.93 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  47.93 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  46.99 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  46.18 
 
 		 360 aa  299  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  47.51 
 
 		 365 aa  298  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 353 aa  298  9e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  46.2 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  46.55 
 
 		 355 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  46.2 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  47.06 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  46.09 
 
 		 350 aa  295  9e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 		 354 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  44.96 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  45.29 
 
 		 354 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  47.37 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  46.67 
 
 		 352 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 		 355 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  45.24 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  45.8 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  43.35 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  45.71 
 
 		 392 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  47.14 
 
 		 354 aa  292  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  45.43 
 
 		 392 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 		 355 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  44.22 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  47.7 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  41.98 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  44.25 
 
 		 354 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  44.86 
 
 		 378 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  45.14 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  46.2 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  45.14 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  44.51 
 
 		 354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  45.14 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  44.41 
 
 		 355 aa  288  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  43.97 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  43.64 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  45.14 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  46.02 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  45.71 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  45.71 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  45.71 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0126  uroporphyrinogen decarboxylase  45.14 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>