More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0217 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  100 
 
 		 413 aa  832    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  55.56 
 
 		 413 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  45.7 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  43.41 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  36.75 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  36.54 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  36.57 
 
 		 450 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  34.59 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  36.01 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  37.65 
 
 		 391 aa  190  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  33.56 
 
 		 439 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  37.17 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  32.25 
 
 		 417 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  31.87 
 
 		 427 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  32.2 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  32.17 
 
 		 433 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  30.71 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  28.17 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  30.12 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  30.41 
 
 		 423 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  32.63 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  28.61 
 
 		 406 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  29.68 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  31.61 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  30.1 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  28.5 
 
 		 419 aa  143  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  35.36 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  29.4 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  28.33 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  28.03 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  28.32 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  28.1 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  28.99 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  29 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  28.2 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.56 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  30.69 
 
 		 418 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.99 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  25.99 
 
 		 414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  26.54 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  27.23 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  28.14 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  27.09 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 432 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  26.94 
 
 		 444 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  27.49 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  27.49 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  27.49 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  28.71 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  27.36 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  24.88 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  26.54 
 
 		 397 aa  110  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  27.7 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  25.48 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  27.18 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  26.51 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  27.34 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.37 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.12 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.18 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  24.52 
 
 		 404 aa  106  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  25.06 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  26.99 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  25.06 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  26.67 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  26.97 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  24.94 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  27.54 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  24.38 
 
 		 409 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  24.94 
 
 		 404 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  24.75 
 
 		 395 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  24.5 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  28.29 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  25.06 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  24.76 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  24.27 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27.94 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  24.53 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  24.53 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  28.19 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  26.43 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0063  DNA integration/recombination/inversion protein  24.22 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  28.05 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  23.91 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  24.27 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  26.17 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  26.1 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  25.89 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  23.2 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  25.3 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  23.79 
 
 		 391 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  25.67 
 
 		 393 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  25.06 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  25.56 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>