More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1038 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  61.44 
 
 		 774 aa  972    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  61.57 
 
 		 774 aa  973    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  80.69 
 
 		 774 aa  1286    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  96.68 
 
 		 782 aa  1562    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  61.31 
 
 		 774 aa  969    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 782 aa  1603    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  61.57 
 
 		 774 aa  972    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  83.59 
 
 		 777 aa  1361    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  65.51 
 
 		 784 aa  1004    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  67.26 
 
 		 784 aa  1042    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  61.44 
 
 		 774 aa  972    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  66.67 
 
 		 784 aa  1025    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  78.46 
 
 		 774 aa  1285    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  48.47 
 
 		 687 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  45.21 
 
 		 809 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  44.43 
 
 		 809 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  44.31 
 
 		 809 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  43.82 
 
 		 807 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  43.98 
 
 		 809 aa  592  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  46.55 
 
 		 721 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  46.63 
 
 		 721 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  45.38 
 
 		 717 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  44.89 
 
 		 731 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  43.82 
 
 		 723 aa  544  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  44.67 
 
 		 720 aa  541  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  42.73 
 
 		 708 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  41.91 
 
 		 693 aa  480  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  33.44 
 
 		 675 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 		 696 aa  319  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  32.41 
 
 		 712 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 703 aa  308  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 		 704 aa  307  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  32.45 
 
 		 690 aa  300  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 731 aa  296  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.98 
 
 		 713 aa  285  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 688 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 		 710 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 711 aa  256  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 782 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 700 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.47 
 
 		 705 aa  143  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  24.18 
 
 		 807 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  30.32 
 
 		 518 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 810 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 813 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 738 aa  125  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  21.36 
 
 		 778 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 709 aa  122  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 801 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  22.18 
 
 		 810 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  22.5 
 
 		 808 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  23.04 
 
 		 809 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 806 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  22.66 
 
 		 810 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  22.48 
 
 		 810 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 801 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 		 809 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  23.84 
 
 		 737 aa  111  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 700 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 700 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 700 aa  110  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 802 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 795 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 821 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  22.12 
 
 		 779 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 773 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 800 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25.63 
 
 		 706 aa  108  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 700 aa  108  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25.48 
 
 		 721 aa  107  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.48 
 
 		 706 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  22.78 
 
 		 799 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 736 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 701 aa  107  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.62 
 
 		 700 aa  106  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 700 aa  106  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  21.87 
 
 		 833 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.48 
 
 		 706 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 700 aa  106  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.62 
 
 		 700 aa  106  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.48 
 
 		 706 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 820 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 828 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  23.27 
 
 		 793 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  22.27 
 
 		 824 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 706 aa  102  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.68 
 
 		 728 aa  100  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 798 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  21.78 
 
 		 696 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 815 aa  100  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  22.61 
 
 		 828 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 797 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  21.78 
 
 		 696 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  21.78 
 
 		 696 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  21.64 
 
 		 698 aa  98.2  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 751 aa  97.4  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 828 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 802 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  21.64 
 
 		 696 aa  97.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>