More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2224 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  39.47 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  37.19 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  39.42 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 		 202 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  38.68 
 
 		 322 aa  85.5  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4458  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  34.23 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4449  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 439 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.943681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2387  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 209 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0159935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  41.76 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  35.79 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  33.88 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4504  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 138 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.991851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 143 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  33.96 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2729  AraC family transcription regulator  36.11 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0590  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.988044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2849  AraC family transcription regulator  36.11 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  37 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1774  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1738  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2788  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2428  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2863  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1788  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  37.4 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1557  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  38.54 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 678 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  31.29 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2126  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330362  normal  0.517633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0699  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1057  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0171524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1060  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1178  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1156  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>