More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4458 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4458  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 446 aa  930    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4449  AraC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.943681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  35.51 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  39.18 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 285 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2387  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 128 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000368739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2484  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 128 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151206  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  35.16 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 287 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  35.16 
 
 		 287 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 287 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  41.76 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 287 aa  66.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 300 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 300 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.04 
 
 		 291 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  39.08 
 
 		 180 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 296 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  35.35 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  36.46 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 128 aa  63.9  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  32.61 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  31.58 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  37.11 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  41.76 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  37.89 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 255 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4621  transcriptional regulator ArgR  34.78 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 287 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1802  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 281 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 331 aa  63.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52740  transcriptional regulator ArgR  34.78 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  36.26 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 271 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  32.99 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 255 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  30.53 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2357  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  39.56 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>