More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0719 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  531  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  64.43 
 
 		 263 aa  346  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  58.37 
 
 		 289 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  57.98 
 
 		 289 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  58.27 
 
 		 288 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  58.06 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5964  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.6 
 
 		 263 aa  294  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  54.44 
 
 		 263 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  56.02 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  54.66 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  55.2 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  56.8 
 
 		 256 aa  279  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6448  ABC transporter related  52.12 
 
 		 263 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0465386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  54.62 
 
 		 256 aa  278  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.73 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  58.33 
 
 		 260 aa  275  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 254 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  54.96 
 
 		 242 aa  274  9e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  54.69 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.57 
 
 		 245 aa  273  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 254 aa  271  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  56.68 
 
 		 264 aa  272  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.72 
 
 		 242 aa  271  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  56.61 
 
 		 257 aa  271  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  54.22 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  56 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  54.4 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  55.33 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  54.4 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  57.5 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  57.08 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.71 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  53.72 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  53.6 
 
 		 274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  57.2 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  55.37 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  52.44 
 
 		 248 aa  268  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 254 aa  268  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  54.4 
 
 		 254 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.98 
 
 		 276 aa  268  8e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  53.94 
 
 		 263 aa  268  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.46 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0412  ABC transporter foramino acid ATP-binding protein  52.21 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.123929  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6087  ABC transporter related  52.17 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  53.88 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  53.25 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  54.73 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 260 aa  265  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 245 aa  265  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.13 
 
 		 243 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  55.37 
 
 		 262 aa  265  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  55.97 
 
 		 243 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  51.59 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 		 264 aa  264  8.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  55.14 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  53.25 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  53.88 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.28 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.91 
 
 		 278 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.62 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  53.91 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  51.24 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  51.85 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  54.73 
 
 		 243 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  55.42 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  53.06 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  54.13 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  52.82 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  51.64 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  51.85 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.97 
 
 		 240 aa  262  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.26 
 
 		 244 aa  262  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  54.01 
 
 		 249 aa  261  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.38 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  56.17 
 
 		 246 aa  261  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 		 248 aa  261  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  54.13 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  55.28 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  53.47 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2412  ABC transporter related  53.69 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.1 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.13 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.06 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  55.04 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.1 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  55.37 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  50.61 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  53.31 
 
 		 254 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  51.63 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.27 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  53.31 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  53.31 
 
 		 254 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>