132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5341 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  69.25 
 
 		 748 aa  1042    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  100 
 
 		 741 aa  1490    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  93.66 
 
 		 741 aa  1365    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  69.65 
 
 		 740 aa  1055    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  63.21 
 
 		 750 aa  913    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  60.49 
 
 		 748 aa  890    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  59.25 
 
 		 741 aa  883    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  69.29 
 
 		 748 aa  1043    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  62.42 
 
 		 750 aa  905    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  69.03 
 
 		 748 aa  1042    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  69.39 
 
 		 747 aa  1054    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  28.92 
 
 		 741 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  28.29 
 
 		 789 aa  269  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  30.15 
 
 		 699 aa  259  9e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  27.09 
 
 		 745 aa  249  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  28.41 
 
 		 712 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  26.35 
 
 		 812 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  27.98 
 
 		 742 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  26.76 
 
 		 682 aa  188  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  25 
 
 		 711 aa  163  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  24.58 
 
 		 732 aa  162  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  23.55 
 
 		 794 aa  158  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  25.59 
 
 		 797 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  22.43 
 
 		 695 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  24.34 
 
 		 725 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  22.4 
 
 		 703 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  26.28 
 
 		 508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  22.65 
 
 		 695 aa  123  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  26.28 
 
 		 502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  22.73 
 
 		 719 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  23.65 
 
 		 709 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  23.31 
 
 		 656 aa  109  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  23.29 
 
 		 643 aa  107  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  23.12 
 
 		 606 aa  101  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  21.85 
 
 		 893 aa  99.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  23.01 
 
 		 614 aa  99.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  24.69 
 
 		 606 aa  99  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  23.01 
 
 		 611 aa  99  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  25.73 
 
 		 606 aa  97.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.77 
 
 		 606 aa  96.3  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  25.49 
 
 		 606 aa  96.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  21.98 
 
 		 614 aa  95.5  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  25.08 
 
 		 606 aa  94.4  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  23.71 
 
 		 607 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  23.71 
 
 		 607 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  21.01 
 
 		 711 aa  91.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  25.69 
 
 		 608 aa  92  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  23.1 
 
 		 607 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  22.86 
 
 		 701 aa  90.9  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  20.8 
 
 		 762 aa  89.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  23.2 
 
 		 704 aa  89  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  23.1 
 
 		 607 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  29.32 
 
 		 696 aa  88.6  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  28.92 
 
 		 826 aa  88.6  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  24.01 
 
 		 612 aa  88.6  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  24.85 
 
 		 677 aa  82.8  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  24.23 
 
 		 611 aa  82  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  25.58 
 
 		 645 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  26.55 
 
 		 604 aa  79  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  24.02 
 
 		 640 aa  75.1  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  25.63 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1955  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1070 aa  70.9  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574298  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  28.02 
 
 		 609 aa  68.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  34.85 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  20.75 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  23.11 
 
 		 649 aa  67.8  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1217 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  26.05 
 
 		 655 aa  64.3  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  25.3 
 
 		 649 aa  62  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  20.63 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  24.7 
 
 		 655 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0854  AsmA family protein  22.34 
 
 		 715 aa  58.5  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000187162  hitchhiker  0.00000372454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  23.9 
 
 		 654 aa  57.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  23.43 
 
 		 677 aa  57.4  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  27.43 
 
 		 640 aa  57.4  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  24.24 
 
 		 649 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  25.46 
 
 		 1013 aa  55.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  24.39 
 
 		 604 aa  55.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  24.09 
 
 		 611 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0931  hypothetical protein  23.93 
 
 		 513 aa  53.9  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  24.09 
 
 		 611 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  26.47 
 
 		 618 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  26.47 
 
 		 618 aa  53.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  26.47 
 
 		 618 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0961  hypothetical protein  23.36 
 
 		 513 aa  52.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  20.75 
 
 		 618 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  20.75 
 
 		 618 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  24.91 
 
 		 705 aa  52.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  23.35 
 
 		 602 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  20.75 
 
 		 618 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  20.75 
 
 		 618 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  20.75 
 
 		 618 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  21.08 
 
 		 1247 aa  50.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  22.87 
 
 		 648 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  29.91 
 
 		 615 aa  50.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  19.37 
 
 		 1278 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  29.52 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  29.52 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  29.52 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  24.06 
 
 		 265 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>