223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0369 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0046  porin, putative  69.91 
 
 		 447 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  69.91 
 
 		 447 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  100 
 
 		 441 aa  906    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  82.31 
 
 		 441 aa  772    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  94.33 
 
 		 441 aa  860    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  74.38 
 
 		 441 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  69.91 
 
 		 447 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  69.91 
 
 		 447 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  73.09 
 
 		 447 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  70.77 
 
 		 447 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  71 
 
 		 447 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  67.59 
 
 		 440 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  65.76 
 
 		 446 aa  592  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  61.14 
 
 		 455 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  60.09 
 
 		 448 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  46.17 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  43.95 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  42.63 
 
 		 479 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  41.57 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  43.43 
 
 		 454 aa  312  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  40 
 
 		 443 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  41.14 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  39.51 
 
 		 444 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  40.13 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  40.35 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  41.59 
 
 		 448 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  39.91 
 
 		 421 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  38.86 
 
 		 448 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  37.95 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  37.95 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  38.36 
 
 		 422 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  41.33 
 
 		 452 aa  286  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  38 
 
 		 444 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  37.67 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  38.22 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  38.75 
 
 		 438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  38 
 
 		 444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  38.36 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  36.43 
 
 		 445 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  36.89 
 
 		 445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  40.95 
 
 		 414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  37.41 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  38.02 
 
 		 417 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  36.41 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  34.47 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  34.17 
 
 		 435 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  35.6 
 
 		 427 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  35.63 
 
 		 420 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  35.98 
 
 		 452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  35.4 
 
 		 420 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  35.4 
 
 		 420 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  35.9 
 
 		 452 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  37.56 
 
 		 409 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  35.22 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  33.33 
 
 		 467 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  34.38 
 
 		 416 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  33.11 
 
 		 423 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  35 
 
 		 425 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  34.87 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  37.07 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  36.24 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  36.04 
 
 		 439 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  34.1 
 
 		 411 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  34.92 
 
 		 421 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  35.38 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  35.33 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  33.78 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  32.73 
 
 		 429 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  33.76 
 
 		 472 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  32.81 
 
 		 418 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  35.16 
 
 		 439 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  35.16 
 
 		 439 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  34.35 
 
 		 429 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  34.05 
 
 		 421 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  33.8 
 
 		 468 aa  229  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  34.05 
 
 		 421 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  34.62 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  35.22 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  34.48 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  33.33 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  36.16 
 
 		 431 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  34.87 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  36.16 
 
 		 431 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  34.11 
 
 		 429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  32.88 
 
 		 413 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  33.88 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  34.02 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  34.18 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  32.57 
 
 		 417 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  34.62 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  33.63 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  32.57 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  33.41 
 
 		 419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  34.47 
 
 		 433 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  33.78 
 
 		 412 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  34.51 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  33.26 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  33.56 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  33.79 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4295  outer membrane porin  35.05 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0341226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>