114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_28359 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_28359  predicted protein  100 
 
 		 229 aa  472  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.45008  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01122  60S ribosomal protein L1 (AFU_orthologue; AFUA_1G11710)  63.13 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.455126  normal  0.294849 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45590  Ribosomal protein L10a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  59.8 
 
 		 216 aa  231  7.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00106944  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03920  60s ribosomal protein l1-a (l10a), putative  56.52 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89215  predicted protein  55.26 
 
 		 217 aa  224  9e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1928  50S ribosomal protein L1P  30.95 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0465  50S ribosomal protein L1P  30.1 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.464703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1601  50S ribosomal protein L1P  29.56 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.670719  normal  0.978998 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1655  50S ribosomal protein L1P  29.15 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2251  50S ribosomal protein L1P  26.26 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000243616  normal  0.144507 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0656  50S ribosomal protein L1P  28.5 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000420977  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1421  50S ribosomal protein L1P  30.3 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0413  50S ribosomal protein L1P  27.84 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0692285  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1833  50S ribosomal protein L1P  30.54 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.927774 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1581  50S ribosomal protein L1P  29.44 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000241017  hitchhiker  0.00650077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0163  50S ribosomal protein L1P  26.26 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.636993 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0862  ribosomal protein L1  27.64 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1273  50S ribosomal protein L1P  27.37 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1316  ribosomal protein L1  30.69 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.685162  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2186  50S ribosomal protein L1P  27.92 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1946  50S ribosomal protein L1P  27.32 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0223976  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1413  50S ribosomal protein L1P  25.79 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1635  50S ribosomal protein L1P  31.96 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0573324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1517  ribosomal protein L1  27.14 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1263  50S ribosomal protein L1P  25.26 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.968535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0693  50S ribosomal protein L1P  25.26 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2535  50S ribosomal protein L1P  28.87 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.305257  normal  0.182251 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3518  ribosomal protein L1  26.63 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0613577  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0254  50S ribosomal protein L1P  26.77 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0614  50S ribosomal protein L1P  27.46 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0223  50S ribosomal protein L1P  30.94 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.449707  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0382  50S ribosomal protein L1  22.63 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.929915 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0189  50S ribosomal protein L1P  28.43 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  28.5 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  26.26 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  28.1 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0394  50S ribosomal protein L1  26.87 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.351464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  26.4 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  27.14 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  27.14 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  27.14 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  26.92 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  27.01 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  26.92 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  27.4 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02791  50S ribosomal protein L1  27.01 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.475982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  23.86 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  26.92 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  26.13 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  26.4 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  24.37 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  24.37 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  25.36 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  24.75 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15606  predicted protein  26.79 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  23.86 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  26.09 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  25.24 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  24.63 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  24.62 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  24.87 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0255  50S ribosomal protein L1  24.5 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  25.5 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  25.5 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  26.13 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  26 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  24.63 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  25.7 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  24.37 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  23.9 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  25.12 
 
 		 233 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  25.74 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  27.18 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  22.38 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  25.5 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  22.22 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  24.37 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  22.33 
 
 		 242 aa  45.1  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  25.12 
 
 		 233 aa  45.1  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  25.75 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  23.76 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  27.18 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  23.23 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  26.76 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  24.76 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  22.22 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  25.69 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4012  50S ribosomal protein L1  23.19 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0669177  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  23.86 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1039  50S ribosomal protein L1  23.67 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0123648  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  23.9 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  23.19 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  24.15 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  23.19 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  23.19 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  24.37 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  24 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  27.62 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  24.88 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  25.5 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>