More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27518 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05972  Coatomer subunit beta', putative (Eurofung)  48.03 
 
 
853 aa  857    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.296123 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27518  predicted protein  100 
 
 
962 aa  1989    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05570  ER to Golgi transport-related protein, putative  47.97 
 
 
829 aa  822    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446639  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77338  predicted protein  43.09 
 
 
922 aa  723    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98376  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48514  predicted protein  50.52 
 
 
931 aa  901    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  26.43 
 
 
1205 aa  276  9e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00480  coatomer alpha subunit, putative  26.42 
 
 
1222 aa  270  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24382  predicted protein  26.16 
 
 
1222 aa  253  8.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87280  predicted protein  24.3 
 
 
1204 aa  246  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0864133  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21929  predicted protein  25.71 
 
 
1270 aa  244  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.1 
 
 
1523 aa  146  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.91 
 
 
1454 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  32.68 
 
 
1163 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.89 
 
 
1213 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  32.3 
 
 
1878 aa  136  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.97 
 
 
1364 aa  134  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  33.94 
 
 
1363 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.73 
 
 
1652 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.48 
 
 
1831 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28.92 
 
 
1196 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  30.8 
 
 
696 aa  128  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  37.44 
 
 
577 aa  128  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.16 
 
 
947 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.74 
 
 
677 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.11 
 
 
1236 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.3 
 
 
1208 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.85 
 
 
1193 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.82 
 
 
1557 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.22 
 
 
676 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  28.74 
 
 
578 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.59 
 
 
1474 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.57 
 
 
1868 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.46 
 
 
576 aa  117  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  30.12 
 
 
742 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.84 
 
 
1807 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  32.93 
 
 
790 aa  115  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.46 
 
 
1221 aa  115  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.74 
 
 
1188 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.5 
 
 
792 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  28.2 
 
 
1411 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.24 
 
 
1901 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.32 
 
 
596 aa  111  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.84 
 
 
1609 aa  111  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 
418 aa  109  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.44 
 
 
1623 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  23.17 
 
 
505 aa  110  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  29.78 
 
 
443 aa  110  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 
1190 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.17 
 
 
434 aa  108  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.55 
 
 
1856 aa  108  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  30.36 
 
 
657 aa  107  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.08 
 
 
1267 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.45 
 
 
682 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  30.4 
 
 
1552 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.93 
 
 
664 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.63 
 
 
630 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.52 
 
 
1760 aa  105  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  29.48 
 
 
1443 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.5 
 
 
1686 aa  105  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.84 
 
 
1188 aa  104  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  27.27 
 
 
840 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25.26 
 
 
1247 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.6 
 
 
1553 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.89 
 
 
1240 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.84 
 
 
1262 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.82 
 
 
1598 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  29.11 
 
 
782 aa  102  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  32.24 
 
 
1858 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.49 
 
 
344 aa  102  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.32 
 
 
1416 aa  102  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46672  WD repeat protein  32.69 
 
 
317 aa  102  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.94 
 
 
698 aa  101  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
954 aa  101  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.82 
 
 
1626 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.74 
 
 
565 aa  100  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  29.82 
 
 
1367 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.12 
 
 
930 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  25.99 
 
 
728 aa  99  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  24.15 
 
 
316 aa  99  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.77 
 
 
1214 aa  98.6  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.89 
 
 
1607 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.94 
 
 
1684 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
687 aa  98.6  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.92 
 
 
1357 aa  97.8  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  26.56 
 
 
363 aa  97.8  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  29.7 
 
 
1661 aa  97.8  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  26.3 
 
 
439 aa  97.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  30.34 
 
 
617 aa  96.3  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  26.44 
 
 
344 aa  96.3  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.63 
 
 
675 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.35 
 
 
1211 aa  96.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  28.64 
 
 
778 aa  96.3  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.02 
 
 
1583 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  27.95 
 
 
335 aa  95.9  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.74 
 
 
1711 aa  95.5  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.46 
 
 
1217 aa  95.1  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.64 
 
 
1599 aa  95.5  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26 
 
 
1547 aa  94.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.52 
 
 
733 aa  94.7  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.98 
 
 
740 aa  94.7  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>