More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0006 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  100 
 
 
442 aa  886  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  41.42 
 
 
461 aa  321  2e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  1.45997e-07  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  39.27 
 
 
455 aa  310  4e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  39.45 
 
 
455 aa  304  2e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  3.20959e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  37.47 
 
 
455 aa  303  6e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  37.16 
 
 
454 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78713e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  38.74 
 
 
454 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  38.3 
 
 
455 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  38.07 
 
 
455 aa  292  8e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  37.93 
 
 
449 aa  286  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.24124e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  36.96 
 
 
477 aa  277  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  3.48389e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  34.7 
 
 
455 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  35 
 
 
456 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  34.72 
 
 
447 aa  259  5e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  34.23 
 
 
460 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  34.34 
 
 
447 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  34.44 
 
 
466 aa  255  1e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  34.34 
 
 
449 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  36.02 
 
 
456 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  37.99 
 
 
454 aa  250  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  32.7 
 
 
460 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  34.37 
 
 
464 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  33.72 
 
 
452 aa  244  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  37.07 
 
 
456 aa  243  5e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  33.49 
 
 
447 aa  236  8e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  33.33 
 
 
451 aa  234  2e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.72656e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  32.1 
 
 
496 aa  233  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  36.05 
 
 
466 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  31.98 
 
 
448 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
448 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  9.11844e-09 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  31.69 
 
 
448 aa  225  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  33.02 
 
 
455 aa  223  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  34.31 
 
 
461 aa  220  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  30.73 
 
 
466 aa  220  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.28 
 
 
447 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  31.11 
 
 
451 aa  219  8e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  33.25 
 
 
451 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  8.73712e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  31.05 
 
 
448 aa  219  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  30.11 
 
 
493 aa  216  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
470 aa  215  1e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  31.43 
 
 
462 aa  213  5e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.21151e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  31.97 
 
 
460 aa  213  5e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.99125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  27.59 
 
 
452 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
452 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  29.93 
 
 
450 aa  208  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
451 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
451 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  30.61 
 
 
446 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  27.51 
 
 
451 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  27.51 
 
 
451 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  27.74 
 
 
451 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  27.88 
 
 
451 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  29.91 
 
 
466 aa  202  7e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.19 
 
 
472 aa  202  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  27.38 
 
 
451 aa  202  1e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  27.17 
 
 
451 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  26.57 
 
 
451 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  29.48 
 
 
496 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.77 
 
 
459 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  8.24418e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  29.46 
 
 
464 aa  193  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  29.45 
 
 
442 aa  192  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  29.43 
 
 
447 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  28.11 
 
 
440 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
439 aa  186  7e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
452 aa  186  8e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  30.49 
 
 
451 aa  180  5e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  30.49 
 
 
451 aa  180  5e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  29.22 
 
 
465 aa  179  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  30.23 
 
 
451 aa  179  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  29.44 
 
 
458 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
445 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.67124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  28.8 
 
 
440 aa  176  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  28.8 
 
 
459 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  28.84 
 
 
450 aa  174  3e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  28.84 
 
 
450 aa  174  3e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  28.84 
 
 
448 aa  173  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  28.51 
 
 
456 aa  173  6e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  29.44 
 
 
448 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  28.84 
 
 
450 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.6 
 
 
456 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.2927e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  29.44 
 
 
449 aa  167  3e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.49 
 
 
451 aa  166  6e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  27.88 
 
 
468 aa  165  2e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.8 
 
 
459 aa  165  2e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  29.61 
 
 
435 aa  164  2e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  30.43 
 
 
467 aa  163  5e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  30 
 
 
451 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  28.24 
 
 
464 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  27.6 
 
 
461 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.51 
 
 
459 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
460 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.79 
 
 
434 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.90306e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  28.57 
 
 
454 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  27.09 
 
 
472 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.99 
 
 
460 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  28.54 
 
 
449 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  27.15 
 
 
443 aa  154  3e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  23.92 
 
 
451 aa  153  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  28.86 
 
 
457 aa  153  6e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.77 
 
 
460 aa  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>