More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3719 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  100 
 
 
420 aa  854  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  82.67 
 
 
420 aa  670  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  93.81 
 
 
415 aa  691  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  81.75 
 
 
418 aa  655  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  79.33 
 
 
419 aa  604  1e-172  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  79.33 
 
 
419 aa  604  1e-172  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  79.33 
 
 
419 aa  605  1e-172  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  78.62 
 
 
419 aa  606  1e-172  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  79.33 
 
 
419 aa  604  1e-172  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  2.32279e-07 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  79.33 
 
 
419 aa  604  1e-172  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  78.62 
 
 
419 aa  606  1e-172  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  79.33 
 
 
419 aa  604  1e-172  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  79.33 
 
 
419 aa  604  1e-172  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  78.62 
 
 
419 aa  606  1e-172  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  78.62 
 
 
419 aa  606  1e-172  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  79.33 
 
 
419 aa  604  1e-172  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  78.62 
 
 
419 aa  606  1e-172  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  79.1 
 
 
419 aa  602  1e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  79.33 
 
 
421 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0433  FtsH protease regulator HflK  82.27 
 
 
419 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0562883  unclonable  3.48967e-08 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0697  FtsH protease regulator HflK  79.52 
 
 
419 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3796  FtsH protease regulator HflK  78.86 
 
 
420 aa  564  1e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3651  FtsH protease regulator HflK  78.86 
 
 
420 aa  564  1e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  66.19 
 
 
386 aa  513  1e-144  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  55.8 
 
 
420 aa  415  1e-115  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  55.15 
 
 
407 aa  405  1e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  53.69 
 
 
381 aa  405  1e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  54.72 
 
 
386 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  53.69 
 
 
381 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  50.47 
 
 
379 aa  401  1e-110  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.08673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  53.85 
 
 
401 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  50.7 
 
 
379 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.88714e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  50.7 
 
 
379 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  4.65537e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  50.7 
 
 
379 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.2736e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  51.81 
 
 
380 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  52.93 
 
 
381 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  1.31875e-06 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  52.85 
 
 
401 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  51.61 
 
 
395 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  54.09 
 
 
377 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  49.39 
 
 
382 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  50.64 
 
 
381 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  51.11 
 
 
382 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  49.76 
 
 
383 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  50.38 
 
 
386 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  55.83 
 
 
380 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3236  HflK protein  52.63 
 
 
390 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0144208  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  51.72 
 
 
383 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  50.53 
 
 
381 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  51.22 
 
 
379 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  3.20742e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  44.16 
 
 
414 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  6.33953e-12 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  43.12 
 
 
389 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  45.75 
 
 
400 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  41.13 
 
 
403 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  42.43 
 
 
395 aa  286  3e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  41.83 
 
 
386 aa  286  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  42.75 
 
 
393 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.71 
 
 
405 aa  286  6e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  45.21 
 
 
399 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  42.4 
 
 
413 aa  284  2e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  43.33 
 
 
389 aa  284  3e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  43.49 
 
 
400 aa  282  7e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  41.69 
 
 
406 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  43.77 
 
 
394 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  41.71 
 
 
380 aa  270  3e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  41.43 
 
 
380 aa  269  7e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  42.22 
 
 
393 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  42.37 
 
 
405 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  42.37 
 
 
393 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  42.7 
 
 
393 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1279  HflK protein  38.52 
 
 
452 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  38.74 
 
 
395 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  37.89 
 
 
395 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  37.31 
 
 
433 aa  256  7e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  39.66 
 
 
435 aa  254  1e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  36.71 
 
 
464 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  35.97 
 
 
477 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  36.69 
 
 
471 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  32.21 
 
 
503 aa  247  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  37.4 
 
 
447 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  45.1 
 
 
351 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  37.29 
 
 
475 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  37.77 
 
 
436 aa  245  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  38.44 
 
 
399 aa  244  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  35.89 
 
 
452 aa  243  4e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  37.64 
 
 
459 aa  243  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  3.63385e-10 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  31.07 
 
 
498 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  38.46 
 
 
451 aa  240  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  38.46 
 
 
451 aa  240  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  37.25 
 
 
474 aa  239  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  34.38 
 
 
457 aa  236  5e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.17 
 
 
378 aa  234  2e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  36.91 
 
 
447 aa  233  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  40 
 
 
391 aa  232  8e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  2.87062e-07 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  38.84 
 
 
471 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  36.76 
 
 
456 aa  231  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  36.59 
 
 
464 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  34.52 
 
 
465 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  7.6277e-06 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  33.79 
 
 
460 aa  214  3e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  34.58 
 
 
385 aa  213  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  32.71 
 
 
466 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  3.21559e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>