71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15580 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  58.29 
 
 		 622 aa  658    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  38.17 
 
 		 912 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  64.96 
 
 		 928 aa  1233    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  74.62 
 
 		 928 aa  1433    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  67.43 
 
 		 932 aa  1263    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  52.34 
 
 		 929 aa  926    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  59.83 
 
 		 909 aa  1093    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  63.08 
 
 		 918 aa  1178    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  69.95 
 
 		 926 aa  1337    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  100 
 
 		 926 aa  1915    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  62.7 
 
 		 921 aa  1191    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  37.92 
 
 		 914 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  35.54 
 
 		 916 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  37.44 
 
 		 871 aa  570  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  36.94 
 
 		 937 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  34.13 
 
 		 908 aa  485  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  33.69 
 
 		 933 aa  479  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  32.03 
 
 		 909 aa  443  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  33.53 
 
 		 928 aa  446  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  34.51 
 
 		 919 aa  433  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  33.21 
 
 		 934 aa  426  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  31.77 
 
 		 934 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  33.37 
 
 		 929 aa  406  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  32.98 
 
 		 941 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  33.04 
 
 		 955 aa  396  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1173 aa  135  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1151 aa  134  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  23.49 
 
 		 925 aa  133  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  27.35 
 
 		 978 aa  126  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  26.91 
 
 		 621 aa  115  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  23.57 
 
 		 973 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1184 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  23.07 
 
 		 918 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0349  hypothetical protein  62.11 
 
 		 115 aa  108  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270538  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1188 aa  107  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1154 aa  106  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1018 aa  100  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1170 aa  97.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  21.57 
 
 		 1186 aa  88.6  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  22.17 
 
 		 869 aa  78.2  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1346 aa  75.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  25.38 
 
 		 536 aa  69.3  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1347 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1365 aa  65.1  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  34.09 
 
 		 97 aa  62  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1363 aa  61.6  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1282 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1409 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  22.08 
 
 		 694 aa  58.9  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1243 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1440 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1321 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1353 aa  57  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1339 aa  54.7  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  21.8 
 
 		 995 aa  55.1  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1339 aa  54.7  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1298 aa  53.9  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1452 aa  53.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1347 aa  53.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1366 aa  52  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  30.18 
 
 		 1041 aa  52  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1339 aa  48.5  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.75 
 
 		 1058 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1036 aa  46.2  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  28.3 
 
 		 504 aa  46.2  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  36.36 
 
 		 1205 aa  46.2  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1422 aa  45.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  42.03 
 
 		 1180 aa  45.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1342 aa  45.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  26.94 
 
 		 950 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1373 aa  44.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>