59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2301 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  100 
 
 		 399 aa  825    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  52.68 
 
 		 408 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  52.38 
 
 		 403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  51.13 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  47.97 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  49.25 
 
 		 408 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  45.25 
 
 		 604 aa  342  7e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  46.68 
 
 		 541 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  45.77 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  45.43 
 
 		 693 aa  318  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  44.07 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  43 
 
 		 535 aa  315  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  42.93 
 
 		 567 aa  315  8e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  44.22 
 
 		 548 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  40.84 
 
 		 547 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  43.3 
 
 		 597 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  40.76 
 
 		 568 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  40.31 
 
 		 558 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  37.43 
 
 		 727 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  34.85 
 
 		 850 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  33.56 
 
 		 535 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  36.6 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  34.81 
 
 		 677 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  32.86 
 
 		 658 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  33.42 
 
 		 574 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  33.64 
 
 		 535 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  33.18 
 
 		 532 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  31.93 
 
 		 640 aa  200  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  39.32 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  30.57 
 
 		 533 aa  186  5e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  33.14 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  28.87 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  32.91 
 
 		 631 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  29.17 
 
 		 636 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.23 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  30.52 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  26.82 
 
 		 583 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  26.17 
 
 		 737 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 589 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  25.72 
 
 		 612 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  23.31 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  24.5 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  27.53 
 
 		 587 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  22.29 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  23.96 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  25.62 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  24.07 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  24.88 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.11 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  26.12 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  25.16 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  23.43 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  21.61 
 
 		 1172 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  22.67 
 
 		 938 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  34.48 
 
 		 734 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  34.44 
 
 		 657 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  31.82 
 
 		 723 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.61 
 
 		 699 aa  43.5  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  26.19 
 
 		 700 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>