More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3968 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  87.13 
 
 		 537 aa  951    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 537 aa  1091    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  74.4 
 
 		 533 aa  776    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  73.63 
 
 		 536 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  45.35 
 
 		 533 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  47.19 
 
 		 534 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  46.18 
 
 		 528 aa  458  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  43.84 
 
 		 538 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  42.75 
 
 		 538 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  42.57 
 
 		 538 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  42.38 
 
 		 538 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  43 
 
 		 524 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 		 544 aa  361  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  40.93 
 
 		 544 aa  355  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.2 
 
 		 539 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  39.55 
 
 		 544 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.63 
 
 		 534 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  38.58 
 
 		 560 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  40.37 
 
 		 495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  39.59 
 
 		 542 aa  336  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  38.88 
 
 		 534 aa  336  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  41.3 
 
 		 524 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  39.8 
 
 		 528 aa  329  8e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  37.68 
 
 		 520 aa  325  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  35.94 
 
 		 535 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.08 
 
 		 532 aa  322  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  37.66 
 
 		 534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  37.84 
 
 		 558 aa  316  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.35 
 
 		 529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  34.94 
 
 		 535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  36.38 
 
 		 529 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  36.57 
 
 		 529 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 		 529 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 		 536 aa  302  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  36.52 
 
 		 515 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  37.06 
 
 		 532 aa  293  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 534 aa  287  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  36.84 
 
 		 522 aa  286  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  36.42 
 
 		 522 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 		 516 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  33.83 
 
 		 527 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.91 
 
 		 531 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 		 535 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 		 535 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 		 531 aa  281  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 		 517 aa  277  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  34.65 
 
 		 533 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  35.33 
 
 		 532 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 527 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.14 
 
 		 531 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  34.32 
 
 		 516 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 		 530 aa  261  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 539 aa  259  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 530 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 531 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.9 
 
 		 541 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 538 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  27.01 
 
 		 576 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 555 aa  180  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.89 
 
 		 556 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.08 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.14 
 
 		 540 aa  178  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.13 
 
 		 538 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 565 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.37 
 
 		 529 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.71 
 
 		 529 aa  171  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.43 
 
 		 528 aa  171  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.43 
 
 		 528 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.07 
 
 		 528 aa  171  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.43 
 
 		 528 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.43 
 
 		 528 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.55 
 
 		 534 aa  170  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  28.12 
 
 		 546 aa  170  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.07 
 
 		 528 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 529 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 540 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.27 
 
 		 516 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 541 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 520 aa  163  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 559 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.23 
 
 		 508 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.56 
 
 		 540 aa  160  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  28.2 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  29.01 
 
 		 517 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 528 aa  158  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  29.92 
 
 		 553 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  29.63 
 
 		 522 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1611  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 259 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.09 
 
 		 505 aa  157  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 520 aa  156  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 509 aa  156  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 		 580 aa  155  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.41 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 539 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>