More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0136 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 504 aa  981    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.73 
 
 		 541 aa  555  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.39 
 
 		 536 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.33 
 
 		 531 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.48 
 
 		 534 aa  482  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  62 
 
 		 493 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.89 
 
 		 510 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  48.66 
 
 		 540 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.72 
 
 		 519 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.26 
 
 		 558 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.65 
 
 		 523 aa  353  5e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.61 
 
 		 501 aa  342  5.999999999999999e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.95 
 
 		 485 aa  317  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.25 
 
 		 479 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.25 
 
 		 509 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.42 
 
 		 559 aa  295  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 		 517 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.4 
 
 		 483 aa  280  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.11 
 
 		 488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.11 
 
 		 491 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.48 
 
 		 579 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.05 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.96 
 
 		 578 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.29 
 
 		 558 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.77 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  41.4 
 
 		 536 aa  256  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.14 
 
 		 473 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.36 
 
 		 473 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.8 
 
 		 514 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 		 545 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.92 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.08 
 
 		 463 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.4 
 
 		 515 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.3 
 
 		 461 aa  239  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.81 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  31.4 
 
 		 455 aa  236  7e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  39.26 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.39 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  31.39 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  33.17 
 
 		 480 aa  230  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.17 
 
 		 480 aa  230  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 537 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.87 
 
 		 515 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.83 
 
 		 534 aa  229  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.64 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.88 
 
 		 511 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 		 485 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.65 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  32.69 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.11 
 
 		 476 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.94 
 
 		 510 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 		 524 aa  223  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.98 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.44 
 
 		 599 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.17 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.65 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.7 
 
 		 521 aa  220  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.74 
 
 		 599 aa  220  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.72 
 
 		 570 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.57 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.57 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.57 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.87 
 
 		 520 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  30.51 
 
 		 493 aa  215  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 		 554 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  33.65 
 
 		 599 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  34.41 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  34.41 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  34.41 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  34.41 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  34.41 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  34.41 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  34.41 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 527 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 527 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 599 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.65 
 
 		 599 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 599 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.65 
 
 		 599 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  33.41 
 
 		 599 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.41 
 
 		 599 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 579 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 		 530 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 597 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 		 506 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 523 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 523 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.06 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31 
 
 		 529 aa  209  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  31.55 
 
 		 436 aa  209  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
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