206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0703 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  100 
 
 		 418 aa  855    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  77.99 
 
 		 409 aa  672    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  82.06 
 
 		 414 aa  705    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  60.14 
 
 		 410 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  59.32 
 
 		 409 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  52.54 
 
 		 498 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  57.21 
 
 		 416 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  55.74 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  54.94 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  53.14 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  48.56 
 
 		 410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  58.12 
 
 		 528 aa  352  8e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  60.22 
 
 		 537 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  59.12 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  41.71 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  38.46 
 
 		 412 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  37.74 
 
 		 414 aa  306  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  37.74 
 
 		 414 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  37.5 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  37.87 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  38.97 
 
 		 423 aa  295  8e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  37.24 
 
 		 515 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  41.05 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  37.11 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  38.63 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  39.13 
 
 		 410 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  35.31 
 
 		 483 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  37.38 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  40.92 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  38.27 
 
 		 410 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  38.76 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  36.73 
 
 		 414 aa  275  8e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  36.49 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  36.52 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  36.96 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  36.71 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  36.71 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  36.71 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  36.71 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  36.71 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  36.71 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  36.71 
 
 		 400 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  36.47 
 
 		 400 aa  266  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  36.39 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  36.39 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  36.14 
 
 		 400 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  36.28 
 
 		 400 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  37.56 
 
 		 425 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  35.71 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  33.79 
 
 		 506 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  32.86 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  35.62 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  35.26 
 
 		 409 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  33.51 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  32.09 
 
 		 412 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  36.59 
 
 		 417 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  33.42 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  33.42 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.43 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.84 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  32.51 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  31.97 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  29.76 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.55 
 
 		 418 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  36.09 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  37.7 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  37.32 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  33.79 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  34.8 
 
 		 415 aa  146  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  34.65 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  34.46 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  35.14 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.35 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  31.68 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.1 
 
 		 400 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  33.45 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  33.44 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  32.35 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  33.66 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  29.41 
 
 		 413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  36.2 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.72 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  32.05 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  28.94 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.94 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  33.88 
 
 		 375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  33.58 
 
 		 380 aa  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  32.09 
 
 		 381 aa  132  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  30.55 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.11 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  29.08 
 
 		 409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  36.7 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  31.34 
 
 		 381 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  31.34 
 
 		 381 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  31.37 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  33.89 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  30.97 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  31.87 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>