More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0349 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  100 
 
 
301 aa  583  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  66.06 
 
 
280 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  65.59 
 
 
290 aa  345  5e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  65.95 
 
 
282 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  65.47 
 
 
284 aa  340  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  64.69 
 
 
284 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  63.31 
 
 
301 aa  331  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  66.19 
 
 
294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  65.34 
 
 
297 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  64.73 
 
 
276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.16 
 
 
313 aa  319  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  58.99 
 
 
301 aa  305  9.000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  61.21 
 
 
289 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  61.09 
 
 
317 aa  295  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  56.07 
 
 
285 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  52.35 
 
 
281 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  50.34 
 
 
304 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  50.88 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.36 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  49.82 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  44.24 
 
 
283 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
312 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  40.62 
 
 
305 aa  222  7e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  40.28 
 
 
301 aa  220  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  37.79 
 
 
308 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  43.56 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  42.54 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  41.25 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  38.94 
 
 
310 aa  212  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  52.53 
 
 
314 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.38 
 
 
308 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  50 
 
 
321 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  50.68 
 
 
312 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  43.26 
 
 
333 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  42.09 
 
 
300 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  44.34 
 
 
309 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  47.06 
 
 
319 aa  202  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.86 
 
 
301 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  52.29 
 
 
237 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  48.09 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  50.46 
 
 
302 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
338 aa  198  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
300 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  48.39 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  48.39 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  48.39 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.85 
 
 
304 aa  195  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  49.3 
 
 
319 aa  195  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
319 aa  195  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.29 
 
 
295 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  43.31 
 
 
299 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 
300 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  48.17 
 
 
319 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  49.07 
 
 
303 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  42.11 
 
 
300 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  41.85 
 
 
313 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  40.87 
 
 
300 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  45.07 
 
 
254 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
300 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  49.52 
 
 
324 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
300 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
300 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  40.78 
 
 
322 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
342 aa  192  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  47.93 
 
 
306 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 
294 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  37.05 
 
 
310 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  43 
 
 
308 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 
313 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  41.2 
 
 
339 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  41.91 
 
 
330 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  42.48 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  39.67 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  48.66 
 
 
323 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  52.76 
 
 
374 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  42.86 
 
 
256 aa  188  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  48.61 
 
 
299 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 
305 aa  188  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  48.61 
 
 
314 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  47.66 
 
 
310 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  37.62 
 
 
305 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  43.36 
 
 
331 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  36.96 
 
 
305 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  45.45 
 
 
302 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  43.4 
 
 
309 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  41.41 
 
 
299 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  40 
 
 
321 aa  185  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  41.83 
 
 
315 aa  185  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  39.74 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.27 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  41.14 
 
 
756 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  36.75 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  39.35 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>