More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2768 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  913    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  64.97 
 
 		 443 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  63.66 
 
 		 439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  58.03 
 
 		 450 aa  512  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  58.72 
 
 		 444 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  58.72 
 
 		 444 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  58.72 
 
 		 444 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  54.88 
 
 		 442 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  58.89 
 
 		 451 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  55.43 
 
 		 448 aa  498  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  55.2 
 
 		 446 aa  498  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  59.02 
 
 		 430 aa  498  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  55.33 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  53.62 
 
 		 442 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  56.48 
 
 		 462 aa  491  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  54.86 
 
 		 433 aa  482  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  54.4 
 
 		 440 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  54.86 
 
 		 443 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  53.15 
 
 		 442 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  57.11 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  55.84 
 
 		 432 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  54.52 
 
 		 435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  55.32 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  57.14 
 
 		 442 aa  468  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  54.94 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  54.13 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  54.65 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  52.57 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  52.35 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  53.47 
 
 		 445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  54.23 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  51.35 
 
 		 451 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  48.53 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  49.66 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  50.93 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  50 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  50 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  45.35 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  43.75 
 
 		 434 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  44.84 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  43.15 
 
 		 468 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  42.39 
 
 		 468 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  33.8 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  30.3 
 
 		 478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.33 
 
 		 477 aa  179  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  29.84 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  30.53 
 
 		 469 aa  173  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  28.42 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  30.33 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  30.43 
 
 		 497 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  28.73 
 
 		 467 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  30.51 
 
 		 493 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  28.96 
 
 		 473 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  31.9 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  27.97 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  28.77 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  32.41 
 
 		 493 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  29.7 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  28.18 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  31.19 
 
 		 493 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.24 
 
 		 549 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  31.88 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  26.32 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  26.53 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  29.49 
 
 		 507 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  29.49 
 
 		 507 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  28.3 
 
 		 487 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.47 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  27.52 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  28.26 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.64 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  26.81 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  26.83 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.7 
 
 		 393 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  25.53 
 
 		 485 aa  106  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.9 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  26.08 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  29.48 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  26.86 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  27.66 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  23.85 
 
 		 477 aa  101  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  27.69 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  26 
 
 		 494 aa  97.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  25.87 
 
 		 415 aa  97.1  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  27.02 
 
 		 415 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  25.27 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  26.38 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  28.5 
 
 		 396 aa  93.6  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  25.5 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  24.36 
 
 		 591 aa  92  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.73 
 
 		 404 aa  90.1  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  26.36 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  29.24 
 
 		 373 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  27.24 
 
 		 390 aa  89.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  26.19 
 
 		 374 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.07 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  24.85 
 
 		 413 aa  87  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  24.62 
 
 		 483 aa  86.7  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.2 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.84 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>