More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4342 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  84.23 
 
 		 225 aa  374  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  62.83 
 
 		 198 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  62.83 
 
 		 198 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  62.83 
 
 		 198 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  53.16 
 
 		 205 aa  221  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  29.7 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  29.21 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  40 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  30.97 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  37.1 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>