More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2832 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 179 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  40.94 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 192 aa  104  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  40.13 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  45.64 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 204 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  36.56 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 195 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 181 aa  92.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  37.08 
 
 		 185 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  34.39 
 
 		 225 aa  87.8  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
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NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
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NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
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NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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