160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1792 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 275 aa  547  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  91.27 
 
 		 275 aa  465  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  63.33 
 
 		 290 aa  331  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  44.53 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  45.61 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  45.26 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  45.07 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  44.72 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2878  ABC-2 type transporter  23.17 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.06 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.03 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.95 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  31.65 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  27.38 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  33.1 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.2 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.82 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.73 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.16 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.87 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 375 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.47 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.14 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  27.53 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.56 
 
 		 249 aa  52.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 		 260 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  22.17 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  27.4 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  28.57 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 443 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  28.66 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.07 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.57 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2239  hypothetical protein  28.8 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.627796  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  31.72 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 		 241 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 356 aa  49.3  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.08 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3318  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561179  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 363 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  29.25 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.04 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0127  ABC-2 transporter component  25.11 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1603  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  39.53 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  24.47 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  32.42 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0173  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00869778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  22.84 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 		 360 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  25.12 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0009  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 		 232 aa  46.2  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  27.95 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  27.13 
 
 		 369 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  27.15 
 
 		 226 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 		 372 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  27.15 
 
 		 226 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  21.79 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>